Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F1

CEP44, Centrosomal protein of 44 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP44Q9C0F1 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CEP44Q9C0F1 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CEP44Q9C0F1 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CEP44Q9C0F1 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CEP44Q9C0F1 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CEP44Q9C0F1 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CEP44Q9C0F1 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CEP44Q9C0F1 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CEP44Q9C0F1 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
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