Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RNF17Q9BXT8 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RNF17Q9BXT8 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RNF17Q9BXT8 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RNF17Q9BXT8 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RNF17Q9BXT8 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
RNF17Q9BXT8 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RNF17Q9BXT8 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
RNF17Q9BXT8 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RNF17Q9BXT8 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RNF17Q9BXT8 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RNF17Q9BXT8 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RNF17Q9BXT8 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RNF17Q9BXT8 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RNF17Q9BXT8 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RNF17Q9BXT8 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
RNF17Q9BXT8 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
RNF17Q9BXT8 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
RNF17Q9BXT8 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RNF17Q9BXT8 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
RNF17Q9BXT8 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RNF17Q9BXT8 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RNF17Q9BXT8 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RNF17Q9BXT8 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RNF17Q9BXT8 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RNF17Q9BXT8 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RNF17Q9BXT8 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RNF17Q9BXT8 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RNF17Q9BXT8 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RNF17Q9BXT8 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
RNF17Q9BXT8 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RNF17Q9BXT8 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RNF17Q9BXT8 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RNF17Q9BXT8 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RNF17Q9BXT8 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RNF17Q9BXT8 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RNF17Q9BXT8 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RNF17Q9BXT8 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
RNF17Q9BXT8 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RNF17Q9BXT8 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RNF17Q9BXT8 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RNF17Q9BXT8 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RNF17Q9BXT8 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RNF17Q9BXT8 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RNF17Q9BXT8 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RNF17Q9BXT8 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RNF17Q9BXT8 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RNF17Q9BXT8 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RNF17Q9BXT8 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RNF17Q9BXT8 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RNF17Q9BXT8 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RNF17Q9BXT8 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RNF17Q9BXT8 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RNF17Q9BXT8 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RNF17Q9BXT8 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RNF17Q9BXT8 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RNF17Q9BXT8 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RNF17Q9BXT8 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RNF17Q9BXT8 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RNF17Q9BXT8 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
RNF17Q9BXT8 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RNF17Q9BXT8 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RNF17Q9BXT8 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RNF17Q9BXT8 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RNF17Q9BXT8 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RNF17Q9BXT8 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RNF17Q9BXT8 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RNF17Q9BXT8 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RNF17Q9BXT8 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RNF17Q9BXT8 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RNF17Q9BXT8 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RNF17Q9BXT8 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
RNF17Q9BXT8 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
RNF17Q9BXT8 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
RNF17Q9BXT8 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RNF17Q9BXT8 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RNF17Q9BXT8 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RNF17Q9BXT8 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RNF17Q9BXT8 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RNF17Q9BXT8 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RNF17Q9BXT8 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
RNF17Q9BXT8 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RNF17Q9BXT8 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RNF17Q9BXT8 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RNF17Q9BXT8 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RNF17Q9BXT8 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
RNF17Q9BXT8 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RNF17Q9BXT8 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RNF17Q9BXT8 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
RNF17Q9BXT8 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RNF17Q9BXT8 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RNF17Q9BXT8 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RNF17Q9BXT8 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RNF17Q9BXT8 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RNF17Q9BXT8 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RNF17Q9BXT8 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RNF17Q9BXT8 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
RNF17Q9BXT8 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RNF17Q9BXT8 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RNF17Q9BXT8 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms