Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPW8

NIPSNAP1, Protein NipSnap homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP1Q9BPW8 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NIPSNAP1Q9BPW8 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NIPSNAP1Q9BPW8 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NIPSNAP1Q9BPW8 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NIPSNAP1Q9BPW8 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NIPSNAP1Q9BPW8 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NIPSNAP1Q9BPW8 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NIPSNAP1Q9BPW8 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NIPSNAP1Q9BPW8 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NIPSNAP1Q9BPW8 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NIPSNAP1Q9BPW8 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NIPSNAP1Q9BPW8 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NIPSNAP1Q9BPW8 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
NIPSNAP1Q9BPW8 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NIPSNAP1Q9BPW8 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NIPSNAP1Q9BPW8 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NIPSNAP1Q9BPW8 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NIPSNAP1Q9BPW8 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NIPSNAP1Q9BPW8 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NIPSNAP1Q9BPW8 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NIPSNAP1Q9BPW8 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NIPSNAP1Q9BPW8 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NIPSNAP1Q9BPW8 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NIPSNAP1Q9BPW8 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NIPSNAP1Q9BPW8 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NIPSNAP1Q9BPW8 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NIPSNAP1Q9BPW8 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NIPSNAP1Q9BPW8 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NIPSNAP1Q9BPW8 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NIPSNAP1Q9BPW8 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NIPSNAP1Q9BPW8 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NIPSNAP1Q9BPW8 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NIPSNAP1Q9BPW8 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NIPSNAP1Q9BPW8 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
NIPSNAP1Q9BPW8 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NIPSNAP1Q9BPW8 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
NIPSNAP1Q9BPW8 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NIPSNAP1Q9BPW8 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NIPSNAP1Q9BPW8 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NIPSNAP1Q9BPW8 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NIPSNAP1Q9BPW8 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NIPSNAP1Q9BPW8 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NIPSNAP1Q9BPW8 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NIPSNAP1Q9BPW8 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NIPSNAP1Q9BPW8 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NIPSNAP1Q9BPW8 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NIPSNAP1Q9BPW8 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NIPSNAP1Q9BPW8 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NIPSNAP1Q9BPW8 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NIPSNAP1Q9BPW8 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NIPSNAP1Q9BPW8 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NIPSNAP1Q9BPW8 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NIPSNAP1Q9BPW8 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NIPSNAP1Q9BPW8 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NIPSNAP1Q9BPW8 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NIPSNAP1Q9BPW8 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NIPSNAP1Q9BPW8 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NIPSNAP1Q9BPW8 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NIPSNAP1Q9BPW8 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NIPSNAP1Q9BPW8 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NIPSNAP1Q9BPW8 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NIPSNAP1Q9BPW8 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NIPSNAP1Q9BPW8 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NIPSNAP1Q9BPW8 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NIPSNAP1Q9BPW8 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NIPSNAP1Q9BPW8 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NIPSNAP1Q9BPW8 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NIPSNAP1Q9BPW8 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NIPSNAP1Q9BPW8 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NIPSNAP1Q9BPW8 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NIPSNAP1Q9BPW8 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NIPSNAP1Q9BPW8 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NIPSNAP1Q9BPW8 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NIPSNAP1Q9BPW8 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NIPSNAP1Q9BPW8 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NIPSNAP1Q9BPW8 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NIPSNAP1Q9BPW8 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NIPSNAP1Q9BPW8 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NIPSNAP1Q9BPW8 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NIPSNAP1Q9BPW8 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NIPSNAP1Q9BPW8 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
NIPSNAP1Q9BPW8 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
NIPSNAP1Q9BPW8 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NIPSNAP1Q9BPW8 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
NIPSNAP1Q9BPW8 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NIPSNAP1Q9BPW8 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
NIPSNAP1Q9BPW8 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NIPSNAP1Q9BPW8 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
NIPSNAP1Q9BPW8 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NIPSNAP1Q9BPW8 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NIPSNAP1Q9BPW8 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NIPSNAP1Q9BPW8 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NIPSNAP1Q9BPW8 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
NIPSNAP1Q9BPW8 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NIPSNAP1Q9BPW8 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NIPSNAP1Q9BPW8 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NIPSNAP1Q9BPW8 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NIPSNAP1Q9BPW8 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NIPSNAP1Q9BPW8 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NIPSNAP1Q9BPW8 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms