Protein–RNA interactions for Protein: Q96RY7

IFT140, Intraflagellar transport protein 140 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT140Q96RY7 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC27.1■■□□□ 1.93
IFT140Q96RY7 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
IFT140Q96RY7 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
IFT140Q96RY7 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
IFT140Q96RY7 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
IFT140Q96RY7 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
IFT140Q96RY7 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
IFT140Q96RY7 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
IFT140Q96RY7 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
IFT140Q96RY7 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
IFT140Q96RY7 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
IFT140Q96RY7 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
IFT140Q96RY7 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
IFT140Q96RY7 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
IFT140Q96RY7 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
IFT140Q96RY7 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
IFT140Q96RY7 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
IFT140Q96RY7 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
IFT140Q96RY7 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
IFT140Q96RY7 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
IFT140Q96RY7 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
IFT140Q96RY7 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
IFT140Q96RY7 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
IFT140Q96RY7 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
IFT140Q96RY7 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
IFT140Q96RY7 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC27.09■■□□□ 1.93
IFT140Q96RY7 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
IFT140Q96RY7 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
IFT140Q96RY7 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
IFT140Q96RY7 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
IFT140Q96RY7 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
IFT140Q96RY7 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
IFT140Q96RY7 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
IFT140Q96RY7 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
IFT140Q96RY7 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
IFT140Q96RY7 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
IFT140Q96RY7 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
IFT140Q96RY7 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
IFT140Q96RY7 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
IFT140Q96RY7 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
IFT140Q96RY7 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC27.08■■□□□ 1.93
IFT140Q96RY7 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
IFT140Q96RY7 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
IFT140Q96RY7 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
IFT140Q96RY7 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
IFT140Q96RY7 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.92
IFT140Q96RY7 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
IFT140Q96RY7 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
IFT140Q96RY7 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
IFT140Q96RY7 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
IFT140Q96RY7 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
IFT140Q96RY7 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
IFT140Q96RY7 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
IFT140Q96RY7 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
IFT140Q96RY7 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
IFT140Q96RY7 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
IFT140Q96RY7 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
IFT140Q96RY7 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
IFT140Q96RY7 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
IFT140Q96RY7 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
IFT140Q96RY7 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
IFT140Q96RY7 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
IFT140Q96RY7 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
IFT140Q96RY7 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
IFT140Q96RY7 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
IFT140Q96RY7 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
IFT140Q96RY7 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
IFT140Q96RY7 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
IFT140Q96RY7 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
IFT140Q96RY7 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
IFT140Q96RY7 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
IFT140Q96RY7 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
IFT140Q96RY7 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
IFT140Q96RY7 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
IFT140Q96RY7 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
IFT140Q96RY7 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
IFT140Q96RY7 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
IFT140Q96RY7 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
IFT140Q96RY7 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
IFT140Q96RY7 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
IFT140Q96RY7 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
IFT140Q96RY7 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
IFT140Q96RY7 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
IFT140Q96RY7 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
IFT140Q96RY7 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
IFT140Q96RY7 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
IFT140Q96RY7 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
IFT140Q96RY7 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
IFT140Q96RY7 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
IFT140Q96RY7 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
IFT140Q96RY7 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
IFT140Q96RY7 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
IFT140Q96RY7 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
IFT140Q96RY7 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
IFT140Q96RY7 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
IFT140Q96RY7 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
IFT140Q96RY7 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
IFT140Q96RY7 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
IFT140Q96RY7 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
IFT140Q96RY7 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms