Protein–RNA interactions for Protein: Q96QS3

ARX, Homeobox protein ARX, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARXQ96QS3 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARXQ96QS3 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARXQ96QS3 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARXQ96QS3 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARXQ96QS3 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARXQ96QS3 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARXQ96QS3 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARXQ96QS3 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARXQ96QS3 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARXQ96QS3 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARXQ96QS3 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARXQ96QS3 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARXQ96QS3 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ARXQ96QS3 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ARXQ96QS3 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARXQ96QS3 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ARXQ96QS3 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ARXQ96QS3 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARXQ96QS3 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARXQ96QS3 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARXQ96QS3 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARXQ96QS3 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ARXQ96QS3 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ARXQ96QS3 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ARXQ96QS3 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARXQ96QS3 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARXQ96QS3 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARXQ96QS3 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARXQ96QS3 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARXQ96QS3 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARXQ96QS3 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARXQ96QS3 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARXQ96QS3 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARXQ96QS3 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ARXQ96QS3 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ARXQ96QS3 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ARXQ96QS3 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ARXQ96QS3 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ARXQ96QS3 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ARXQ96QS3 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ARXQ96QS3 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ARXQ96QS3 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ARXQ96QS3 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ARXQ96QS3 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ARXQ96QS3 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ARXQ96QS3 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ARXQ96QS3 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ARXQ96QS3 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ARXQ96QS3 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ARXQ96QS3 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ARXQ96QS3 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ARXQ96QS3 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ARXQ96QS3 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ARXQ96QS3 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ARXQ96QS3 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ARXQ96QS3 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARXQ96QS3 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARXQ96QS3 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARXQ96QS3 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARXQ96QS3 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARXQ96QS3 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARXQ96QS3 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ARXQ96QS3 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARXQ96QS3 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARXQ96QS3 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARXQ96QS3 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARXQ96QS3 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARXQ96QS3 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARXQ96QS3 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARXQ96QS3 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ARXQ96QS3 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARXQ96QS3 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARXQ96QS3 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARXQ96QS3 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARXQ96QS3 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARXQ96QS3 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARXQ96QS3 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARXQ96QS3 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARXQ96QS3 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARXQ96QS3 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARXQ96QS3 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARXQ96QS3 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARXQ96QS3 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARXQ96QS3 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARXQ96QS3 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARXQ96QS3 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARXQ96QS3 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ARXQ96QS3 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARXQ96QS3 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARXQ96QS3 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARXQ96QS3 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARXQ96QS3 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARXQ96QS3 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARXQ96QS3 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARXQ96QS3 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARXQ96QS3 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARXQ96QS3 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARXQ96QS3 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ARXQ96QS3 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARXQ96QS3 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms