Protein–RNA interactions for Protein: Q96GP6

SCARF2, Scavenger receptor class F member 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF2Q96GP6 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCARF2Q96GP6 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCARF2Q96GP6 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCARF2Q96GP6 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCARF2Q96GP6 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCARF2Q96GP6 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCARF2Q96GP6 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCARF2Q96GP6 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCARF2Q96GP6 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCARF2Q96GP6 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCARF2Q96GP6 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCARF2Q96GP6 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCARF2Q96GP6 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCARF2Q96GP6 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCARF2Q96GP6 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCARF2Q96GP6 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCARF2Q96GP6 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCARF2Q96GP6 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCARF2Q96GP6 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCARF2Q96GP6 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCARF2Q96GP6 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCARF2Q96GP6 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCARF2Q96GP6 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCARF2Q96GP6 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCARF2Q96GP6 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCARF2Q96GP6 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCARF2Q96GP6 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCARF2Q96GP6 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCARF2Q96GP6 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCARF2Q96GP6 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCARF2Q96GP6 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCARF2Q96GP6 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCARF2Q96GP6 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCARF2Q96GP6 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCARF2Q96GP6 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCARF2Q96GP6 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCARF2Q96GP6 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCARF2Q96GP6 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCARF2Q96GP6 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCARF2Q96GP6 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCARF2Q96GP6 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCARF2Q96GP6 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCARF2Q96GP6 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCARF2Q96GP6 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCARF2Q96GP6 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCARF2Q96GP6 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCARF2Q96GP6 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCARF2Q96GP6 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCARF2Q96GP6 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCARF2Q96GP6 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCARF2Q96GP6 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCARF2Q96GP6 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCARF2Q96GP6 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCARF2Q96GP6 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCARF2Q96GP6 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCARF2Q96GP6 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCARF2Q96GP6 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCARF2Q96GP6 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCARF2Q96GP6 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCARF2Q96GP6 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCARF2Q96GP6 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCARF2Q96GP6 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCARF2Q96GP6 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCARF2Q96GP6 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SCARF2Q96GP6 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCARF2Q96GP6 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCARF2Q96GP6 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SCARF2Q96GP6 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCARF2Q96GP6 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCARF2Q96GP6 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCARF2Q96GP6 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCARF2Q96GP6 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCARF2Q96GP6 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCARF2Q96GP6 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCARF2Q96GP6 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCARF2Q96GP6 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCARF2Q96GP6 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCARF2Q96GP6 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCARF2Q96GP6 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCARF2Q96GP6 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCARF2Q96GP6 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCARF2Q96GP6 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCARF2Q96GP6 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCARF2Q96GP6 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCARF2Q96GP6 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCARF2Q96GP6 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCARF2Q96GP6 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCARF2Q96GP6 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCARF2Q96GP6 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCARF2Q96GP6 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SCARF2Q96GP6 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCARF2Q96GP6 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCARF2Q96GP6 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SCARF2Q96GP6 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCARF2Q96GP6 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCARF2Q96GP6 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCARF2Q96GP6 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCARF2Q96GP6 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCARF2Q96GP6 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCARF2Q96GP6 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.4 ms