Protein–RNA interactions for Protein: Q96B97

SH3KBP1, SH3 domain-containing kinase-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3KBP1Q96B97 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SH3KBP1Q96B97 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SH3KBP1Q96B97 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SH3KBP1Q96B97 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SH3KBP1Q96B97 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SH3KBP1Q96B97 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SH3KBP1Q96B97 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SH3KBP1Q96B97 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SH3KBP1Q96B97 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SH3KBP1Q96B97 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SH3KBP1Q96B97 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SH3KBP1Q96B97 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SH3KBP1Q96B97 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SH3KBP1Q96B97 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SH3KBP1Q96B97 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SH3KBP1Q96B97 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SH3KBP1Q96B97 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SH3KBP1Q96B97 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SH3KBP1Q96B97 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SH3KBP1Q96B97 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SH3KBP1Q96B97 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SH3KBP1Q96B97 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SH3KBP1Q96B97 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SH3KBP1Q96B97 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SH3KBP1Q96B97 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SH3KBP1Q96B97 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SH3KBP1Q96B97 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SH3KBP1Q96B97 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SH3KBP1Q96B97 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SH3KBP1Q96B97 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SH3KBP1Q96B97 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SH3KBP1Q96B97 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SH3KBP1Q96B97 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SH3KBP1Q96B97 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SH3KBP1Q96B97 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SH3KBP1Q96B97 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SH3KBP1Q96B97 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SH3KBP1Q96B97 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SH3KBP1Q96B97 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SH3KBP1Q96B97 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SH3KBP1Q96B97 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SH3KBP1Q96B97 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SH3KBP1Q96B97 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SH3KBP1Q96B97 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SH3KBP1Q96B97 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SH3KBP1Q96B97 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SH3KBP1Q96B97 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SH3KBP1Q96B97 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SH3KBP1Q96B97 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SH3KBP1Q96B97 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SH3KBP1Q96B97 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SH3KBP1Q96B97 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SH3KBP1Q96B97 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SH3KBP1Q96B97 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SH3KBP1Q96B97 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SH3KBP1Q96B97 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SH3KBP1Q96B97 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SH3KBP1Q96B97 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SH3KBP1Q96B97 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SH3KBP1Q96B97 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SH3KBP1Q96B97 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SH3KBP1Q96B97 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SH3KBP1Q96B97 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SH3KBP1Q96B97 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SH3KBP1Q96B97 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SH3KBP1Q96B97 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SH3KBP1Q96B97 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SH3KBP1Q96B97 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SH3KBP1Q96B97 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SH3KBP1Q96B97 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SH3KBP1Q96B97 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SH3KBP1Q96B97 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SH3KBP1Q96B97 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SH3KBP1Q96B97 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SH3KBP1Q96B97 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SH3KBP1Q96B97 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SH3KBP1Q96B97 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SH3KBP1Q96B97 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SH3KBP1Q96B97 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SH3KBP1Q96B97 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SH3KBP1Q96B97 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SH3KBP1Q96B97 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SH3KBP1Q96B97 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SH3KBP1Q96B97 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SH3KBP1Q96B97 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SH3KBP1Q96B97 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SH3KBP1Q96B97 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SH3KBP1Q96B97 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SH3KBP1Q96B97 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SH3KBP1Q96B97 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SH3KBP1Q96B97 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SH3KBP1Q96B97 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SH3KBP1Q96B97 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SH3KBP1Q96B97 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SH3KBP1Q96B97 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SH3KBP1Q96B97 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SH3KBP1Q96B97 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SH3KBP1Q96B97 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SH3KBP1Q96B97 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SH3KBP1Q96B97 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms