Protein–RNA interactions for Protein: Q969X6

UTP4, U3 small nucleolar RNA-associated protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP4Q969X6 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms