Protein–RNA interactions for Protein: Q93088

BHMT, Betaine--homocysteine S-methyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMTQ93088 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BHMTQ93088 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
BHMTQ93088 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BHMTQ93088 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BHMTQ93088 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BHMTQ93088 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BHMTQ93088 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BHMTQ93088 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BHMTQ93088 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BHMTQ93088 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BHMTQ93088 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
BHMTQ93088 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BHMTQ93088 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BHMTQ93088 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BHMTQ93088 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
BHMTQ93088 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BHMTQ93088 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BHMTQ93088 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BHMTQ93088 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BHMTQ93088 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
BHMTQ93088 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BHMTQ93088 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BHMTQ93088 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BHMTQ93088 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BHMTQ93088 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BHMTQ93088 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BHMTQ93088 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BHMTQ93088 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BHMTQ93088 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BHMTQ93088 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BHMTQ93088 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BHMTQ93088 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BHMTQ93088 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BHMTQ93088 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BHMTQ93088 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BHMTQ93088 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BHMTQ93088 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BHMTQ93088 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BHMTQ93088 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BHMTQ93088 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BHMTQ93088 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BHMTQ93088 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BHMTQ93088 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BHMTQ93088 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BHMTQ93088 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BHMTQ93088 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BHMTQ93088 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BHMTQ93088 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BHMTQ93088 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BHMTQ93088 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BHMTQ93088 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BHMTQ93088 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BHMTQ93088 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BHMTQ93088 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BHMTQ93088 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BHMTQ93088 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BHMTQ93088 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BHMTQ93088 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BHMTQ93088 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BHMTQ93088 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BHMTQ93088 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BHMTQ93088 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
BHMTQ93088 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BHMTQ93088 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BHMTQ93088 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BHMTQ93088 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BHMTQ93088 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
BHMTQ93088 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BHMTQ93088 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BHMTQ93088 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BHMTQ93088 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BHMTQ93088 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
BHMTQ93088 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BHMTQ93088 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
BHMTQ93088 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
BHMTQ93088 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BHMTQ93088 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
BHMTQ93088 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
BHMTQ93088 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
BHMTQ93088 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
BHMTQ93088 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BHMTQ93088 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
BHMTQ93088 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BHMTQ93088 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BHMTQ93088 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BHMTQ93088 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BHMTQ93088 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BHMTQ93088 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BHMTQ93088 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BHMTQ93088 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BHMTQ93088 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BHMTQ93088 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BHMTQ93088 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BHMTQ93088 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
BHMTQ93088 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BHMTQ93088 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BHMTQ93088 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BHMTQ93088 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BHMTQ93088 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BHMTQ93088 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms