Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFW9

MYRIP, Rab effector MyRIP, humanhuman

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYRIPQ8NFW9 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MYRIPQ8NFW9 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MYRIPQ8NFW9 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MYRIPQ8NFW9 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MYRIPQ8NFW9 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MYRIPQ8NFW9 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
MYRIPQ8NFW9 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MYRIPQ8NFW9 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MYRIPQ8NFW9 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MYRIPQ8NFW9 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MYRIPQ8NFW9 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MYRIPQ8NFW9 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MYRIPQ8NFW9 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MYRIPQ8NFW9 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MYRIPQ8NFW9 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MYRIPQ8NFW9 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MYRIPQ8NFW9 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
MYRIPQ8NFW9 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MYRIPQ8NFW9 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
MYRIPQ8NFW9 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MYRIPQ8NFW9 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MYRIPQ8NFW9 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MYRIPQ8NFW9 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MYRIPQ8NFW9 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MYRIPQ8NFW9 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MYRIPQ8NFW9 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MYRIPQ8NFW9 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MYRIPQ8NFW9 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MYRIPQ8NFW9 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MYRIPQ8NFW9 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MYRIPQ8NFW9 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MYRIPQ8NFW9 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MYRIPQ8NFW9 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MYRIPQ8NFW9 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MYRIPQ8NFW9 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
MYRIPQ8NFW9 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MYRIPQ8NFW9 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
MYRIPQ8NFW9 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MYRIPQ8NFW9 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MYRIPQ8NFW9 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
MYRIPQ8NFW9 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MYRIPQ8NFW9 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MYRIPQ8NFW9 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MYRIPQ8NFW9 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
MYRIPQ8NFW9 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MYRIPQ8NFW9 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MYRIPQ8NFW9 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
MYRIPQ8NFW9 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
MYRIPQ8NFW9 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MYRIPQ8NFW9 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
MYRIPQ8NFW9 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MYRIPQ8NFW9 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MYRIPQ8NFW9 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MYRIPQ8NFW9 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MYRIPQ8NFW9 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MYRIPQ8NFW9 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MYRIPQ8NFW9 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MYRIPQ8NFW9 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MYRIPQ8NFW9 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MYRIPQ8NFW9 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MYRIPQ8NFW9 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MYRIPQ8NFW9 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MYRIPQ8NFW9 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MYRIPQ8NFW9 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MYRIPQ8NFW9 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MYRIPQ8NFW9 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MYRIPQ8NFW9 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
MYRIPQ8NFW9 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MYRIPQ8NFW9 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MYRIPQ8NFW9 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
MYRIPQ8NFW9 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
MYRIPQ8NFW9 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
MYRIPQ8NFW9 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MYRIPQ8NFW9 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MYRIPQ8NFW9 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MYRIPQ8NFW9 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MYRIPQ8NFW9 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MYRIPQ8NFW9 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MYRIPQ8NFW9 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
MYRIPQ8NFW9 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MYRIPQ8NFW9 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MYRIPQ8NFW9 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
MYRIPQ8NFW9 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MYRIPQ8NFW9 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MYRIPQ8NFW9 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MYRIPQ8NFW9 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MYRIPQ8NFW9 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
MYRIPQ8NFW9 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MYRIPQ8NFW9 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MYRIPQ8NFW9 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
MYRIPQ8NFW9 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MYRIPQ8NFW9 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MYRIPQ8NFW9 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MYRIPQ8NFW9 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
MYRIPQ8NFW9 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
MYRIPQ8NFW9 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MYRIPQ8NFW9 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MYRIPQ8NFW9 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MYRIPQ8NFW9 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MYRIPQ8NFW9 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.8 ms