Protein–RNA interactions for Protein: Q76G19

PDZD4, PDZ domain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZD4Q76G19 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PDZD4Q76G19 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PDZD4Q76G19 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PDZD4Q76G19 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PDZD4Q76G19 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PDZD4Q76G19 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PDZD4Q76G19 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PDZD4Q76G19 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PDZD4Q76G19 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PDZD4Q76G19 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PDZD4Q76G19 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PDZD4Q76G19 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PDZD4Q76G19 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PDZD4Q76G19 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PDZD4Q76G19 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PDZD4Q76G19 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PDZD4Q76G19 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PDZD4Q76G19 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PDZD4Q76G19 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PDZD4Q76G19 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PDZD4Q76G19 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PDZD4Q76G19 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PDZD4Q76G19 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PDZD4Q76G19 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PDZD4Q76G19 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PDZD4Q76G19 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PDZD4Q76G19 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PDZD4Q76G19 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PDZD4Q76G19 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PDZD4Q76G19 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PDZD4Q76G19 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PDZD4Q76G19 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PDZD4Q76G19 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PDZD4Q76G19 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PDZD4Q76G19 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PDZD4Q76G19 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PDZD4Q76G19 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PDZD4Q76G19 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PDZD4Q76G19 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PDZD4Q76G19 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PDZD4Q76G19 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PDZD4Q76G19 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PDZD4Q76G19 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PDZD4Q76G19 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PDZD4Q76G19 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PDZD4Q76G19 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PDZD4Q76G19 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PDZD4Q76G19 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PDZD4Q76G19 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PDZD4Q76G19 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PDZD4Q76G19 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PDZD4Q76G19 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PDZD4Q76G19 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PDZD4Q76G19 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PDZD4Q76G19 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PDZD4Q76G19 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PDZD4Q76G19 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PDZD4Q76G19 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PDZD4Q76G19 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PDZD4Q76G19 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PDZD4Q76G19 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PDZD4Q76G19 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PDZD4Q76G19 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PDZD4Q76G19 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PDZD4Q76G19 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PDZD4Q76G19 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PDZD4Q76G19 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PDZD4Q76G19 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PDZD4Q76G19 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PDZD4Q76G19 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PDZD4Q76G19 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PDZD4Q76G19 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PDZD4Q76G19 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PDZD4Q76G19 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PDZD4Q76G19 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PDZD4Q76G19 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PDZD4Q76G19 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PDZD4Q76G19 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PDZD4Q76G19 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PDZD4Q76G19 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PDZD4Q76G19 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PDZD4Q76G19 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PDZD4Q76G19 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PDZD4Q76G19 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PDZD4Q76G19 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PDZD4Q76G19 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PDZD4Q76G19 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PDZD4Q76G19 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PDZD4Q76G19 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PDZD4Q76G19 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PDZD4Q76G19 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PDZD4Q76G19 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PDZD4Q76G19 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PDZD4Q76G19 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PDZD4Q76G19 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PDZD4Q76G19 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PDZD4Q76G19 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PDZD4Q76G19 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PDZD4Q76G19 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PDZD4Q76G19 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.4 ms