Protein–RNA interactions for Protein: Q16795

NDUFA9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA9Q16795 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDUFA9Q16795 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDUFA9Q16795 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDUFA9Q16795 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDUFA9Q16795 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDUFA9Q16795 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDUFA9Q16795 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NDUFA9Q16795 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NDUFA9Q16795 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDUFA9Q16795 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDUFA9Q16795 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDUFA9Q16795 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDUFA9Q16795 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDUFA9Q16795 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NDUFA9Q16795 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDUFA9Q16795 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NDUFA9Q16795 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NDUFA9Q16795 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NDUFA9Q16795 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDUFA9Q16795 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDUFA9Q16795 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDUFA9Q16795 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDUFA9Q16795 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDUFA9Q16795 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDUFA9Q16795 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDUFA9Q16795 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NDUFA9Q16795 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NDUFA9Q16795 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NDUFA9Q16795 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NDUFA9Q16795 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NDUFA9Q16795 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NDUFA9Q16795 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NDUFA9Q16795 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NDUFA9Q16795 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NDUFA9Q16795 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NDUFA9Q16795 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
NDUFA9Q16795 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NDUFA9Q16795 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NDUFA9Q16795 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NDUFA9Q16795 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NDUFA9Q16795 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NDUFA9Q16795 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NDUFA9Q16795 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NDUFA9Q16795 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NDUFA9Q16795 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NDUFA9Q16795 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NDUFA9Q16795 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NDUFA9Q16795 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NDUFA9Q16795 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NDUFA9Q16795 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NDUFA9Q16795 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NDUFA9Q16795 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NDUFA9Q16795 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NDUFA9Q16795 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NDUFA9Q16795 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDUFA9Q16795 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDUFA9Q16795 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDUFA9Q16795 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDUFA9Q16795 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDUFA9Q16795 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDUFA9Q16795 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDUFA9Q16795 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NDUFA9Q16795 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDUFA9Q16795 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDUFA9Q16795 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDUFA9Q16795 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDUFA9Q16795 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDUFA9Q16795 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDUFA9Q16795 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDUFA9Q16795 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDUFA9Q16795 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDUFA9Q16795 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDUFA9Q16795 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDUFA9Q16795 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDUFA9Q16795 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NDUFA9Q16795 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDUFA9Q16795 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDUFA9Q16795 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDUFA9Q16795 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDUFA9Q16795 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDUFA9Q16795 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDUFA9Q16795 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDUFA9Q16795 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDUFA9Q16795 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDUFA9Q16795 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDUFA9Q16795 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NDUFA9Q16795 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDUFA9Q16795 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDUFA9Q16795 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDUFA9Q16795 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDUFA9Q16795 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDUFA9Q16795 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDUFA9Q16795 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDUFA9Q16795 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDUFA9Q16795 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDUFA9Q16795 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDUFA9Q16795 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDUFA9Q16795 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDUFA9Q16795 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDUFA9Q16795 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms