Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ECM1Q16610 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ECM1Q16610 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ECM1Q16610 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ECM1Q16610 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ECM1Q16610 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ECM1Q16610 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ECM1Q16610 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ECM1Q16610 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ECM1Q16610 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ECM1Q16610 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
ECM1Q16610 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ECM1Q16610 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ECM1Q16610 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ECM1Q16610 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
ECM1Q16610 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ECM1Q16610 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ECM1Q16610 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ECM1Q16610 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ECM1Q16610 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ECM1Q16610 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ECM1Q16610 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ECM1Q16610 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ECM1Q16610 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ECM1Q16610 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ECM1Q16610 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ECM1Q16610 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ECM1Q16610 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ECM1Q16610 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ECM1Q16610 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ECM1Q16610 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ECM1Q16610 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
ECM1Q16610 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ECM1Q16610 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ECM1Q16610 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ECM1Q16610 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ECM1Q16610 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ECM1Q16610 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ECM1Q16610 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ECM1Q16610 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ECM1Q16610 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ECM1Q16610 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ECM1Q16610 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ECM1Q16610 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ECM1Q16610 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ECM1Q16610 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ECM1Q16610 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ECM1Q16610 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ECM1Q16610 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ECM1Q16610 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ECM1Q16610 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ECM1Q16610 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ECM1Q16610 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ECM1Q16610 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ECM1Q16610 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ECM1Q16610 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ECM1Q16610 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ECM1Q16610 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ECM1Q16610 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ECM1Q16610 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ECM1Q16610 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ECM1Q16610 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ECM1Q16610 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ECM1Q16610 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ECM1Q16610 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ECM1Q16610 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ECM1Q16610 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ECM1Q16610 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ECM1Q16610 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ECM1Q16610 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ECM1Q16610 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ECM1Q16610 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ECM1Q16610 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ECM1Q16610 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ECM1Q16610 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ECM1Q16610 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ECM1Q16610 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ECM1Q16610 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ECM1Q16610 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ECM1Q16610 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ECM1Q16610 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ECM1Q16610 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ECM1Q16610 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ECM1Q16610 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ECM1Q16610 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ECM1Q16610 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ECM1Q16610 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ECM1Q16610 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ECM1Q16610 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ECM1Q16610 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ECM1Q16610 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ECM1Q16610 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ECM1Q16610 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ECM1Q16610 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ECM1Q16610 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ECM1Q16610 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ECM1Q16610 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ECM1Q16610 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ECM1Q16610 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ECM1Q16610 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
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