Protein–RNA interactions for Protein: Q15004

PCLAF, PCNA-associated factor, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCLAFQ15004 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCLAFQ15004 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCLAFQ15004 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCLAFQ15004 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCLAFQ15004 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCLAFQ15004 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCLAFQ15004 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCLAFQ15004 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCLAFQ15004 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCLAFQ15004 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCLAFQ15004 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCLAFQ15004 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCLAFQ15004 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCLAFQ15004 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCLAFQ15004 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCLAFQ15004 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCLAFQ15004 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCLAFQ15004 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCLAFQ15004 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCLAFQ15004 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCLAFQ15004 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCLAFQ15004 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCLAFQ15004 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCLAFQ15004 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCLAFQ15004 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PCLAFQ15004 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCLAFQ15004 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCLAFQ15004 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCLAFQ15004 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCLAFQ15004 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCLAFQ15004 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCLAFQ15004 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCLAFQ15004 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCLAFQ15004 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCLAFQ15004 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCLAFQ15004 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCLAFQ15004 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCLAFQ15004 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCLAFQ15004 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCLAFQ15004 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PCLAFQ15004 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCLAFQ15004 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCLAFQ15004 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCLAFQ15004 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCLAFQ15004 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCLAFQ15004 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCLAFQ15004 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCLAFQ15004 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCLAFQ15004 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PCLAFQ15004 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PCLAFQ15004 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCLAFQ15004 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCLAFQ15004 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCLAFQ15004 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCLAFQ15004 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCLAFQ15004 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCLAFQ15004 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCLAFQ15004 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCLAFQ15004 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCLAFQ15004 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCLAFQ15004 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCLAFQ15004 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCLAFQ15004 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCLAFQ15004 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PCLAFQ15004 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCLAFQ15004 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCLAFQ15004 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PCLAFQ15004 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCLAFQ15004 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCLAFQ15004 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCLAFQ15004 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCLAFQ15004 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCLAFQ15004 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCLAFQ15004 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCLAFQ15004 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCLAFQ15004 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCLAFQ15004 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCLAFQ15004 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PCLAFQ15004 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCLAFQ15004 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCLAFQ15004 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCLAFQ15004 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PCLAFQ15004 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCLAFQ15004 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCLAFQ15004 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PCLAFQ15004 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCLAFQ15004 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCLAFQ15004 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCLAFQ15004 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCLAFQ15004 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCLAFQ15004 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCLAFQ15004 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCLAFQ15004 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCLAFQ15004 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCLAFQ15004 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PCLAFQ15004 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCLAFQ15004 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCLAFQ15004 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCLAFQ15004 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCLAFQ15004 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms