Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
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