Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CUL1Q13616 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CUL1Q13616 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CUL1Q13616 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CUL1Q13616 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CUL1Q13616 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CUL1Q13616 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CUL1Q13616 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CUL1Q13616 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CUL1Q13616 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CUL1Q13616 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CUL1Q13616 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CUL1Q13616 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CUL1Q13616 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CUL1Q13616 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CUL1Q13616 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CUL1Q13616 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CUL1Q13616 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CUL1Q13616 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CUL1Q13616 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CUL1Q13616 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CUL1Q13616 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CUL1Q13616 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CUL1Q13616 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CUL1Q13616 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CUL1Q13616 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CUL1Q13616 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CUL1Q13616 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CUL1Q13616 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CUL1Q13616 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CUL1Q13616 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CUL1Q13616 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CUL1Q13616 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CUL1Q13616 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CUL1Q13616 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CUL1Q13616 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CUL1Q13616 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CUL1Q13616 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CUL1Q13616 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CUL1Q13616 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CUL1Q13616 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CUL1Q13616 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CUL1Q13616 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CUL1Q13616 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CUL1Q13616 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CUL1Q13616 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CUL1Q13616 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
CUL1Q13616 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
CUL1Q13616 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
CUL1Q13616 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CUL1Q13616 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CUL1Q13616 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CUL1Q13616 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CUL1Q13616 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CUL1Q13616 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CUL1Q13616 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CUL1Q13616 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CUL1Q13616 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CUL1Q13616 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CUL1Q13616 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CUL1Q13616 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CUL1Q13616 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CUL1Q13616 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CUL1Q13616 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CUL1Q13616 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CUL1Q13616 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CUL1Q13616 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CUL1Q13616 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CUL1Q13616 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CUL1Q13616 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CUL1Q13616 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CUL1Q13616 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CUL1Q13616 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CUL1Q13616 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CUL1Q13616 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CUL1Q13616 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CUL1Q13616 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CUL1Q13616 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CUL1Q13616 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CUL1Q13616 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CUL1Q13616 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CUL1Q13616 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CUL1Q13616 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CUL1Q13616 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CUL1Q13616 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CUL1Q13616 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CUL1Q13616 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CUL1Q13616 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CUL1Q13616 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CUL1Q13616 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CUL1Q13616 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CUL1Q13616 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CUL1Q13616 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CUL1Q13616 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CUL1Q13616 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CUL1Q13616 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CUL1Q13616 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CUL1Q13616 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CUL1Q13616 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CUL1Q13616 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
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