Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
CHAF1AQ13111 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
CHAF1AQ13111 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CHAF1AQ13111 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CHAF1AQ13111 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CHAF1AQ13111 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CHAF1AQ13111 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CHAF1AQ13111 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CHAF1AQ13111 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CHAF1AQ13111 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CHAF1AQ13111 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CHAF1AQ13111 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CHAF1AQ13111 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CHAF1AQ13111 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CHAF1AQ13111 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CHAF1AQ13111 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CHAF1AQ13111 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CHAF1AQ13111 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CHAF1AQ13111 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CHAF1AQ13111 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CHAF1AQ13111 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CHAF1AQ13111 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CHAF1AQ13111 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CHAF1AQ13111 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CHAF1AQ13111 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CHAF1AQ13111 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CHAF1AQ13111 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CHAF1AQ13111 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CHAF1AQ13111 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CHAF1AQ13111 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CHAF1AQ13111 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CHAF1AQ13111 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CHAF1AQ13111 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CHAF1AQ13111 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CHAF1AQ13111 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CHAF1AQ13111 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CHAF1AQ13111 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CHAF1AQ13111 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CHAF1AQ13111 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CHAF1AQ13111 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
CHAF1AQ13111 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CHAF1AQ13111 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
CHAF1AQ13111 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CHAF1AQ13111 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
CHAF1AQ13111 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CHAF1AQ13111 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CHAF1AQ13111 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CHAF1AQ13111 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
CHAF1AQ13111 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CHAF1AQ13111 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CHAF1AQ13111 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CHAF1AQ13111 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CHAF1AQ13111 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CHAF1AQ13111 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CHAF1AQ13111 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CHAF1AQ13111 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CHAF1AQ13111 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CHAF1AQ13111 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CHAF1AQ13111 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CHAF1AQ13111 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CHAF1AQ13111 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CHAF1AQ13111 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CHAF1AQ13111 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHAF1AQ13111 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHAF1AQ13111 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CHAF1AQ13111 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHAF1AQ13111 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHAF1AQ13111 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHAF1AQ13111 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHAF1AQ13111 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHAF1AQ13111 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHAF1AQ13111 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHAF1AQ13111 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHAF1AQ13111 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHAF1AQ13111 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHAF1AQ13111 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHAF1AQ13111 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHAF1AQ13111 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHAF1AQ13111 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CHAF1AQ13111 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CHAF1AQ13111 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHAF1AQ13111 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHAF1AQ13111 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHAF1AQ13111 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHAF1AQ13111 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHAF1AQ13111 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CHAF1AQ13111 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHAF1AQ13111 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHAF1AQ13111 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHAF1AQ13111 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CHAF1AQ13111 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHAF1AQ13111 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHAF1AQ13111 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CHAF1AQ13111 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHAF1AQ13111 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHAF1AQ13111 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHAF1AQ13111 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHAF1AQ13111 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHAF1AQ13111 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHAF1AQ13111 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
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