Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXD4Q12950 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXD4Q12950 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXD4Q12950 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXD4Q12950 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXD4Q12950 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXD4Q12950 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXD4Q12950 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXD4Q12950 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXD4Q12950 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXD4Q12950 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXD4Q12950 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXD4Q12950 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXD4Q12950 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXD4Q12950 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXD4Q12950 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXD4Q12950 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXD4Q12950 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXD4Q12950 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXD4Q12950 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXD4Q12950 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXD4Q12950 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXD4Q12950 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXD4Q12950 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXD4Q12950 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXD4Q12950 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXD4Q12950 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXD4Q12950 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXD4Q12950 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXD4Q12950 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXD4Q12950 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXD4Q12950 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXD4Q12950 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXD4Q12950 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXD4Q12950 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXD4Q12950 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXD4Q12950 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXD4Q12950 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXD4Q12950 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXD4Q12950 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXD4Q12950 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXD4Q12950 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXD4Q12950 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXD4Q12950 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXD4Q12950 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXD4Q12950 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXD4Q12950 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXD4Q12950 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXD4Q12950 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXD4Q12950 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXD4Q12950 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXD4Q12950 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXD4Q12950 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXD4Q12950 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXD4Q12950 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXD4Q12950 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXD4Q12950 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXD4Q12950 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXD4Q12950 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXD4Q12950 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXD4Q12950 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXD4Q12950 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXD4Q12950 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXD4Q12950 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXD4Q12950 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXD4Q12950 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXD4Q12950 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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FOXD4Q12950 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXD4Q12950 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXD4Q12950 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXD4Q12950 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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FOXD4Q12950 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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FOXD4Q12950 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXD4Q12950 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXD4Q12950 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXD4Q12950 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXD4Q12950 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXD4Q12950 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXD4Q12950 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXD4Q12950 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXD4Q12950 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXD4Q12950 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXD4Q12950 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXD4Q12950 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXD4Q12950 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXD4Q12950 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXD4Q12950 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXD4Q12950 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXD4Q12950 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXD4Q12950 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXD4Q12950 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXD4Q12950 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXD4Q12950 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXD4Q12950 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXD4Q12950 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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