Protein–RNA interactions for Protein: Q01082

SPTBN1, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN1Q01082 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPTBN1Q01082 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPTBN1Q01082 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPTBN1Q01082 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPTBN1Q01082 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPTBN1Q01082 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SPTBN1Q01082 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPTBN1Q01082 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SPTBN1Q01082 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPTBN1Q01082 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPTBN1Q01082 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPTBN1Q01082 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPTBN1Q01082 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPTBN1Q01082 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPTBN1Q01082 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPTBN1Q01082 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPTBN1Q01082 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPTBN1Q01082 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPTBN1Q01082 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPTBN1Q01082 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPTBN1Q01082 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPTBN1Q01082 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPTBN1Q01082 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPTBN1Q01082 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPTBN1Q01082 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPTBN1Q01082 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPTBN1Q01082 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPTBN1Q01082 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPTBN1Q01082 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.07
SPTBN1Q01082 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
SPTBN1Q01082 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
SPTBN1Q01082 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.07
SPTBN1Q01082 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.07
SPTBN1Q01082 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.07
SPTBN1Q01082 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.07
SPTBN1Q01082 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.07
SPTBN1Q01082 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC14.65□□□□□ -0.07
SPTBN1Q01082 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.07
SPTBN1Q01082 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.07
SPTBN1Q01082 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.07
SPTBN1Q01082 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPTBN1Q01082 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPTBN1Q01082 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPTBN1Q01082 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPTBN1Q01082 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPTBN1Q01082 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPTBN1Q01082 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPTBN1Q01082 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPTBN1Q01082 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPTBN1Q01082 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPTBN1Q01082 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPTBN1Q01082 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPTBN1Q01082 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPTBN1Q01082 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPTBN1Q01082 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPTBN1Q01082 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPTBN1Q01082 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPTBN1Q01082 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPTBN1Q01082 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPTBN1Q01082 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPTBN1Q01082 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPTBN1Q01082 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPTBN1Q01082 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPTBN1Q01082 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPTBN1Q01082 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SPTBN1Q01082 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPTBN1Q01082 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPTBN1Q01082 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPTBN1Q01082 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPTBN1Q01082 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPTBN1Q01082 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPTBN1Q01082 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPTBN1Q01082 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPTBN1Q01082 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPTBN1Q01082 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPTBN1Q01082 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPTBN1Q01082 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPTBN1Q01082 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPTBN1Q01082 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPTBN1Q01082 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPTBN1Q01082 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPTBN1Q01082 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPTBN1Q01082 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPTBN1Q01082 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPTBN1Q01082 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SPTBN1Q01082 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPTBN1Q01082 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPTBN1Q01082 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPTBN1Q01082 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPTBN1Q01082 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPTBN1Q01082 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPTBN1Q01082 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPTBN1Q01082 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPTBN1Q01082 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPTBN1Q01082 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPTBN1Q01082 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPTBN1Q01082 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPTBN1Q01082 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPTBN1Q01082 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPTBN1Q01082 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms