Protein–RNA interactions for Protein: P61550

ERVS71-1, Endogenous retrovirus group S71 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVS71-1P61550 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ERVS71-1P61550 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ERVS71-1P61550 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ERVS71-1P61550 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ERVS71-1P61550 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ERVS71-1P61550 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ERVS71-1P61550 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ERVS71-1P61550 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ERVS71-1P61550 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ERVS71-1P61550 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ERVS71-1P61550 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ERVS71-1P61550 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ERVS71-1P61550 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ERVS71-1P61550 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
ERVS71-1P61550 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ERVS71-1P61550 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
ERVS71-1P61550 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ERVS71-1P61550 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ERVS71-1P61550 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ERVS71-1P61550 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ERVS71-1P61550 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ERVS71-1P61550 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ERVS71-1P61550 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ERVS71-1P61550 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
ERVS71-1P61550 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ERVS71-1P61550 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ERVS71-1P61550 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ERVS71-1P61550 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ERVS71-1P61550 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ERVS71-1P61550 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
ERVS71-1P61550 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ERVS71-1P61550 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ERVS71-1P61550 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ERVS71-1P61550 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ERVS71-1P61550 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ERVS71-1P61550 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ERVS71-1P61550 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ERVS71-1P61550 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ERVS71-1P61550 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ERVS71-1P61550 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ERVS71-1P61550 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ERVS71-1P61550 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ERVS71-1P61550 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
ERVS71-1P61550 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ERVS71-1P61550 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ERVS71-1P61550 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ERVS71-1P61550 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ERVS71-1P61550 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ERVS71-1P61550 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
ERVS71-1P61550 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ERVS71-1P61550 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ERVS71-1P61550 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ERVS71-1P61550 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ERVS71-1P61550 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
ERVS71-1P61550 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ERVS71-1P61550 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ERVS71-1P61550 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
ERVS71-1P61550 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ERVS71-1P61550 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
ERVS71-1P61550 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ERVS71-1P61550 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ERVS71-1P61550 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ERVS71-1P61550 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ERVS71-1P61550 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ERVS71-1P61550 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ERVS71-1P61550 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ERVS71-1P61550 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ERVS71-1P61550 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ERVS71-1P61550 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ERVS71-1P61550 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ERVS71-1P61550 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ERVS71-1P61550 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ERVS71-1P61550 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ERVS71-1P61550 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ERVS71-1P61550 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ERVS71-1P61550 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ERVS71-1P61550 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ERVS71-1P61550 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ERVS71-1P61550 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ERVS71-1P61550 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ERVS71-1P61550 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ERVS71-1P61550 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ERVS71-1P61550 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ERVS71-1P61550 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ERVS71-1P61550 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ERVS71-1P61550 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ERVS71-1P61550 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ERVS71-1P61550 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ERVS71-1P61550 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ERVS71-1P61550 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ERVS71-1P61550 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
ERVS71-1P61550 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ERVS71-1P61550 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ERVS71-1P61550 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ERVS71-1P61550 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
ERVS71-1P61550 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ERVS71-1P61550 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ERVS71-1P61550 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ERVS71-1P61550 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ERVS71-1P61550 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms