Protein–RNA interactions for Protein: P55287

CDH11, Cadherin-11, humanhuman

Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH11P55287 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH11P55287 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH11P55287 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH11P55287 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH11P55287 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH11P55287 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH11P55287 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH11P55287 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH11P55287 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH11P55287 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH11P55287 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH11P55287 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH11P55287 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH11P55287 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH11P55287 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH11P55287 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH11P55287 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH11P55287 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH11P55287 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH11P55287 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH11P55287 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH11P55287 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH11P55287 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH11P55287 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH11P55287 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH11P55287 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH11P55287 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH11P55287 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH11P55287 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH11P55287 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH11P55287 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH11P55287 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH11P55287 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH11P55287 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH11P55287 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH11P55287 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH11P55287 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH11P55287 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH11P55287 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH11P55287 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH11P55287 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH11P55287 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH11P55287 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH11P55287 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH11P55287 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH11P55287 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH11P55287 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH11P55287 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH11P55287 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH11P55287 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH11P55287 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH11P55287 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH11P55287 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH11P55287 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH11P55287 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH11P55287 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH11P55287 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH11P55287 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH11P55287 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH11P55287 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH11P55287 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH11P55287 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH11P55287 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH11P55287 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH11P55287 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH11P55287 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH11P55287 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH11P55287 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH11P55287 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH11P55287 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH11P55287 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH11P55287 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH11P55287 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH11P55287 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH11P55287 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH11P55287 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH11P55287 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH11P55287 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH11P55287 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH11P55287 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH11P55287 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH11P55287 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH11P55287 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDH11P55287 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CDH11P55287 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDH11P55287 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDH11P55287 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDH11P55287 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDH11P55287 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDH11P55287 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDH11P55287 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDH11P55287 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDH11P55287 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDH11P55287 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDH11P55287 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDH11P55287 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDH11P55287 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDH11P55287 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDH11P55287 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CDH11P55287 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms