Protein–RNA interactions for Protein: P54727

RAD23B, UV excision repair protein RAD23 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23BP54727 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAD23BP54727 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAD23BP54727 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAD23BP54727 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAD23BP54727 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAD23BP54727 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAD23BP54727 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAD23BP54727 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
RAD23BP54727 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAD23BP54727 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAD23BP54727 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAD23BP54727 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAD23BP54727 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAD23BP54727 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAD23BP54727 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAD23BP54727 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
RAD23BP54727 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
RAD23BP54727 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
RAD23BP54727 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAD23BP54727 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAD23BP54727 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAD23BP54727 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAD23BP54727 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAD23BP54727 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAD23BP54727 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAD23BP54727 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAD23BP54727 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAD23BP54727 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAD23BP54727 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAD23BP54727 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAD23BP54727 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAD23BP54727 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAD23BP54727 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAD23BP54727 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAD23BP54727 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAD23BP54727 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
RAD23BP54727 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
RAD23BP54727 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAD23BP54727 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAD23BP54727 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAD23BP54727 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAD23BP54727 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAD23BP54727 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAD23BP54727 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAD23BP54727 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAD23BP54727 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAD23BP54727 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAD23BP54727 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAD23BP54727 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAD23BP54727 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAD23BP54727 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAD23BP54727 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAD23BP54727 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAD23BP54727 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAD23BP54727 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAD23BP54727 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAD23BP54727 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAD23BP54727 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAD23BP54727 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAD23BP54727 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAD23BP54727 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAD23BP54727 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAD23BP54727 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAD23BP54727 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAD23BP54727 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
RAD23BP54727 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAD23BP54727 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
RAD23BP54727 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAD23BP54727 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAD23BP54727 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAD23BP54727 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAD23BP54727 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAD23BP54727 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAD23BP54727 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAD23BP54727 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAD23BP54727 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAD23BP54727 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAD23BP54727 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAD23BP54727 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAD23BP54727 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAD23BP54727 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
RAD23BP54727 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAD23BP54727 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAD23BP54727 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAD23BP54727 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAD23BP54727 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAD23BP54727 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAD23BP54727 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
RAD23BP54727 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAD23BP54727 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAD23BP54727 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAD23BP54727 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAD23BP54727 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAD23BP54727 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAD23BP54727 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAD23BP54727 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAD23BP54727 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAD23BP54727 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAD23BP54727 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAD23BP54727 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms