Protein–RNA interactions for Protein: P52209

PGD, 6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGDP52209 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PGDP52209 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PGDP52209 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PGDP52209 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PGDP52209 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PGDP52209 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PGDP52209 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PGDP52209 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PGDP52209 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PGDP52209 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PGDP52209 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PGDP52209 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PGDP52209 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PGDP52209 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PGDP52209 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PGDP52209 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PGDP52209 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PGDP52209 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PGDP52209 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PGDP52209 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PGDP52209 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PGDP52209 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PGDP52209 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PGDP52209 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PGDP52209 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PGDP52209 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PGDP52209 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PGDP52209 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PGDP52209 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PGDP52209 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PGDP52209 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PGDP52209 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PGDP52209 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PGDP52209 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PGDP52209 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PGDP52209 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PGDP52209 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PGDP52209 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PGDP52209 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PGDP52209 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PGDP52209 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PGDP52209 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PGDP52209 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PGDP52209 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PGDP52209 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PGDP52209 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PGDP52209 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PGDP52209 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PGDP52209 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PGDP52209 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PGDP52209 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PGDP52209 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PGDP52209 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PGDP52209 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PGDP52209 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PGDP52209 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PGDP52209 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PGDP52209 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PGDP52209 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PGDP52209 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PGDP52209 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PGDP52209 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PGDP52209 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PGDP52209 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PGDP52209 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PGDP52209 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PGDP52209 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PGDP52209 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PGDP52209 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PGDP52209 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PGDP52209 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PGDP52209 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PGDP52209 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PGDP52209 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PGDP52209 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PGDP52209 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PGDP52209 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PGDP52209 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PGDP52209 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PGDP52209 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PGDP52209 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PGDP52209 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PGDP52209 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PGDP52209 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PGDP52209 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PGDP52209 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PGDP52209 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PGDP52209 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PGDP52209 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PGDP52209 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PGDP52209 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PGDP52209 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PGDP52209 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PGDP52209 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PGDP52209 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PGDP52209 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PGDP52209 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PGDP52209 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PGDP52209 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PGDP52209 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms