Protein–RNA interactions for Protein: P42025

ACTR1B, Beta-centractin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR1BP42025 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACTR1BP42025 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACTR1BP42025 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACTR1BP42025 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACTR1BP42025 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACTR1BP42025 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACTR1BP42025 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACTR1BP42025 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACTR1BP42025 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACTR1BP42025 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACTR1BP42025 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACTR1BP42025 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACTR1BP42025 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACTR1BP42025 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACTR1BP42025 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACTR1BP42025 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ACTR1BP42025 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACTR1BP42025 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACTR1BP42025 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACTR1BP42025 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACTR1BP42025 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACTR1BP42025 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACTR1BP42025 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACTR1BP42025 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACTR1BP42025 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACTR1BP42025 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACTR1BP42025 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ACTR1BP42025 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACTR1BP42025 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACTR1BP42025 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ACTR1BP42025 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ACTR1BP42025 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACTR1BP42025 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ACTR1BP42025 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACTR1BP42025 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ACTR1BP42025 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACTR1BP42025 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACTR1BP42025 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACTR1BP42025 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACTR1BP42025 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACTR1BP42025 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACTR1BP42025 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACTR1BP42025 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACTR1BP42025 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACTR1BP42025 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACTR1BP42025 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACTR1BP42025 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACTR1BP42025 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACTR1BP42025 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACTR1BP42025 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACTR1BP42025 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACTR1BP42025 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACTR1BP42025 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACTR1BP42025 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACTR1BP42025 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACTR1BP42025 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACTR1BP42025 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACTR1BP42025 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACTR1BP42025 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACTR1BP42025 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACTR1BP42025 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACTR1BP42025 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACTR1BP42025 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACTR1BP42025 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACTR1BP42025 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACTR1BP42025 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ACTR1BP42025 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ACTR1BP42025 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACTR1BP42025 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACTR1BP42025 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACTR1BP42025 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACTR1BP42025 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACTR1BP42025 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACTR1BP42025 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACTR1BP42025 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACTR1BP42025 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACTR1BP42025 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACTR1BP42025 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACTR1BP42025 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACTR1BP42025 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACTR1BP42025 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACTR1BP42025 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACTR1BP42025 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACTR1BP42025 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACTR1BP42025 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACTR1BP42025 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ACTR1BP42025 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ACTR1BP42025 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ACTR1BP42025 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ACTR1BP42025 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ACTR1BP42025 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ACTR1BP42025 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ACTR1BP42025 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ACTR1BP42025 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ACTR1BP42025 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ACTR1BP42025 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ACTR1BP42025 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ACTR1BP42025 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ACTR1BP42025 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ACTR1BP42025 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms