Protein–RNA interactions for Protein: P35247

SFTPD, Pulmonary surfactant-associated protein D, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPDP35247 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SFTPDP35247 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SFTPDP35247 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SFTPDP35247 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SFTPDP35247 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SFTPDP35247 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SFTPDP35247 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SFTPDP35247 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SFTPDP35247 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SFTPDP35247 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SFTPDP35247 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SFTPDP35247 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SFTPDP35247 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SFTPDP35247 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SFTPDP35247 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SFTPDP35247 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SFTPDP35247 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SFTPDP35247 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SFTPDP35247 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SFTPDP35247 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SFTPDP35247 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SFTPDP35247 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SFTPDP35247 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SFTPDP35247 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SFTPDP35247 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SFTPDP35247 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SFTPDP35247 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SFTPDP35247 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SFTPDP35247 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SFTPDP35247 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms