Protein–RNA interactions for Protein: P31327

CPS1, Carbamoyl-phosphate synthase [ammonia], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPS1P31327 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CPS1P31327 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CPS1P31327 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CPS1P31327 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CPS1P31327 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CPS1P31327 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CPS1P31327 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CPS1P31327 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.31
CPS1P31327 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.31
CPS1P31327 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.31
CPS1P31327 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
CPS1P31327 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
CPS1P31327 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
CPS1P31327 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CPS1P31327 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CPS1P31327 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CPS1P31327 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CPS1P31327 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CPS1P31327 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CPS1P31327 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CPS1P31327 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CPS1P31327 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CPS1P31327 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CPS1P31327 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CPS1P31327 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CPS1P31327 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CPS1P31327 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CPS1P31327 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CPS1P31327 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CPS1P31327 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CPS1P31327 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CPS1P31327 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CPS1P31327 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CPS1P31327 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CPS1P31327 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CPS1P31327 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CPS1P31327 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CPS1P31327 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CPS1P31327 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CPS1P31327 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CPS1P31327 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CPS1P31327 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CPS1P31327 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CPS1P31327 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CPS1P31327 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CPS1P31327 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CPS1P31327 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CPS1P31327 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CPS1P31327 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CPS1P31327 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CPS1P31327 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CPS1P31327 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CPS1P31327 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CPS1P31327 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CPS1P31327 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CPS1P31327 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CPS1P31327 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CPS1P31327 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CPS1P31327 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CPS1P31327 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CPS1P31327 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CPS1P31327 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CPS1P31327 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CPS1P31327 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CPS1P31327 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CPS1P31327 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CPS1P31327 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CPS1P31327 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CPS1P31327 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CPS1P31327 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CPS1P31327 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CPS1P31327 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CPS1P31327 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CPS1P31327 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CPS1P31327 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CPS1P31327 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CPS1P31327 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CPS1P31327 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CPS1P31327 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CPS1P31327 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CPS1P31327 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CPS1P31327 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CPS1P31327 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CPS1P31327 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CPS1P31327 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CPS1P31327 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CPS1P31327 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CPS1P31327 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CPS1P31327 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CPS1P31327 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CPS1P31327 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CPS1P31327 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CPS1P31327 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CPS1P31327 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CPS1P31327 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CPS1P31327 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CPS1P31327 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CPS1P31327 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CPS1P31327 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CPS1P31327 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms