Protein–RNA interactions for Protein: P29374

ARID4A, AT-rich interactive domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID4AP29374 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ARID4AP29374 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ARID4AP29374 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ARID4AP29374 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ARID4AP29374 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ARID4AP29374 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ARID4AP29374 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ARID4AP29374 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ARID4AP29374 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ARID4AP29374 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARID4AP29374 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARID4AP29374 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARID4AP29374 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARID4AP29374 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ARID4AP29374 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARID4AP29374 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARID4AP29374 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARID4AP29374 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARID4AP29374 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARID4AP29374 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARID4AP29374 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARID4AP29374 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARID4AP29374 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARID4AP29374 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARID4AP29374 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARID4AP29374 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARID4AP29374 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARID4AP29374 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARID4AP29374 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARID4AP29374 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARID4AP29374 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARID4AP29374 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARID4AP29374 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARID4AP29374 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARID4AP29374 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARID4AP29374 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ARID4AP29374 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARID4AP29374 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARID4AP29374 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARID4AP29374 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARID4AP29374 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARID4AP29374 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARID4AP29374 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARID4AP29374 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARID4AP29374 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ARID4AP29374 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARID4AP29374 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARID4AP29374 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARID4AP29374 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARID4AP29374 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARID4AP29374 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ARID4AP29374 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ARID4AP29374 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ARID4AP29374 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ARID4AP29374 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ARID4AP29374 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ARID4AP29374 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ARID4AP29374 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ARID4AP29374 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ARID4AP29374 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ARID4AP29374 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ARID4AP29374 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ARID4AP29374 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ARID4AP29374 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ARID4AP29374 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ARID4AP29374 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ARID4AP29374 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ARID4AP29374 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ARID4AP29374 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ARID4AP29374 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ARID4AP29374 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ARID4AP29374 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ARID4AP29374 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ARID4AP29374 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ARID4AP29374 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ARID4AP29374 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ARID4AP29374 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ARID4AP29374 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ARID4AP29374 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ARID4AP29374 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ARID4AP29374 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ARID4AP29374 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
ARID4AP29374 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ARID4AP29374 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
ARID4AP29374 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ARID4AP29374 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ARID4AP29374 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ARID4AP29374 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ARID4AP29374 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARID4AP29374 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARID4AP29374 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARID4AP29374 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARID4AP29374 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARID4AP29374 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARID4AP29374 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARID4AP29374 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARID4AP29374 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARID4AP29374 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARID4AP29374 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARID4AP29374 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.2 ms