Protein–RNA interactions for Protein: P28288

ABCD3, ATP-binding cassette sub-family D member 3, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD3P28288 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ABCD3P28288 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ABCD3P28288 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ABCD3P28288 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ABCD3P28288 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ABCD3P28288 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ABCD3P28288 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ABCD3P28288 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ABCD3P28288 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ABCD3P28288 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ABCD3P28288 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ABCD3P28288 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ABCD3P28288 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ABCD3P28288 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ABCD3P28288 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ABCD3P28288 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ABCD3P28288 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ABCD3P28288 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ABCD3P28288 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ABCD3P28288 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ABCD3P28288 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ABCD3P28288 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ABCD3P28288 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ABCD3P28288 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ABCD3P28288 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ABCD3P28288 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ABCD3P28288 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ABCD3P28288 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ABCD3P28288 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ABCD3P28288 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ABCD3P28288 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ABCD3P28288 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ABCD3P28288 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ABCD3P28288 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ABCD3P28288 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ABCD3P28288 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ABCD3P28288 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ABCD3P28288 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ABCD3P28288 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ABCD3P28288 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ABCD3P28288 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ABCD3P28288 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ABCD3P28288 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ABCD3P28288 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ABCD3P28288 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ABCD3P28288 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ABCD3P28288 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ABCD3P28288 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ABCD3P28288 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ABCD3P28288 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ABCD3P28288 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ABCD3P28288 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ABCD3P28288 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ABCD3P28288 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ABCD3P28288 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ABCD3P28288 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ABCD3P28288 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms