Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
HLA-DMAP28067 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.4 ms