Protein–RNA interactions for Protein: P25054

APC, Adenomatous polyposis coli protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,843 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APCP25054 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
APCP25054 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
APCP25054 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
APCP25054 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
APCP25054 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
APCP25054 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
APCP25054 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
APCP25054 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.78□□□□□ -0.2
APCP25054 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
APCP25054 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
APCP25054 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
APCP25054 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
APCP25054 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
APCP25054 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
APCP25054 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
APCP25054 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
APCP25054 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
APCP25054 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
APCP25054 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
APCP25054 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
APCP25054 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
APCP25054 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
APCP25054 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
APCP25054 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
APCP25054 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
APCP25054 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
APCP25054 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
APCP25054 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
APCP25054 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
APCP25054 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
APCP25054 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
APCP25054 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
APCP25054 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
APCP25054 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
APCP25054 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
APCP25054 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
APCP25054 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
APCP25054 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
APCP25054 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
APCP25054 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
APCP25054 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
APCP25054 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.2
APCP25054 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
APCP25054 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.2
APCP25054 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
APCP25054 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
APCP25054 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
APCP25054 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.2
APCP25054 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
APCP25054 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
APCP25054 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.2
APCP25054 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC13.77□□□□□ -0.2
APCP25054 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.2
APCP25054 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.2
APCP25054 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC13.77□□□□□ -0.2
APCP25054 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
APCP25054 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC13.77□□□□□ -0.2
APCP25054 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
APCP25054 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
APCP25054 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
APCP25054 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
APCP25054 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
APCP25054 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
APCP25054 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
APCP25054 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
APCP25054 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
APCP25054 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
APCP25054 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
APCP25054 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
APCP25054 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
APCP25054 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
APCP25054 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
APCP25054 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
APCP25054 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
APCP25054 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
APCP25054 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
APCP25054 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC13.77□□□□□ -0.21
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APCP25054 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
APCP25054 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
APCP25054 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
APCP25054 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
APCP25054 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
APCP25054 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
APCP25054 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
APCP25054 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
APCP25054 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
APCP25054 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
APCP25054 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
APCP25054 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
APCP25054 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
APCP25054 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
APCP25054 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
APCP25054 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
APCP25054 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
APCP25054 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC13.77□□□□□ -0.21
APCP25054 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
APCP25054 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
APCP25054 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
APCP25054 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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