Protein–RNA interactions for Protein: P24821

TNC, Tenascin, humanhuman

Predictions only

Length 2,201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNCP24821 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TNCP24821 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TNCP24821 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TNCP24821 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TNCP24821 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TNCP24821 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TNCP24821 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TNCP24821 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TNCP24821 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TNCP24821 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TNCP24821 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TNCP24821 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TNCP24821 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TNCP24821 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
TNCP24821 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TNCP24821 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TNCP24821 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
TNCP24821 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TNCP24821 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TNCP24821 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TNCP24821 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TNCP24821 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TNCP24821 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TNCP24821 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TNCP24821 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TNCP24821 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TNCP24821 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TNCP24821 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TNCP24821 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TNCP24821 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TNCP24821 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TNCP24821 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TNCP24821 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TNCP24821 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TNCP24821 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TNCP24821 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TNCP24821 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TNCP24821 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TNCP24821 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TNCP24821 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TNCP24821 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TNCP24821 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
TNCP24821 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TNCP24821 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TNCP24821 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TNCP24821 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TNCP24821 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TNCP24821 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TNCP24821 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TNCP24821 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TNCP24821 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
TNCP24821 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
TNCP24821 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
TNCP24821 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
TNCP24821 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TNCP24821 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TNCP24821 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
TNCP24821 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TNCP24821 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TNCP24821 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TNCP24821 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TNCP24821 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TNCP24821 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TNCP24821 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TNCP24821 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TNCP24821 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TNCP24821 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TNCP24821 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TNCP24821 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TNCP24821 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TNCP24821 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TNCP24821 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TNCP24821 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TNCP24821 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TNCP24821 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TNCP24821 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
TNCP24821 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TNCP24821 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TNCP24821 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TNCP24821 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TNCP24821 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TNCP24821 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TNCP24821 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TNCP24821 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TNCP24821 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TNCP24821 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TNCP24821 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TNCP24821 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TNCP24821 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
TNCP24821 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TNCP24821 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
TNCP24821 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TNCP24821 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TNCP24821 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TNCP24821 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TNCP24821 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TNCP24821 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TNCP24821 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TNCP24821 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TNCP24821 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms