Protein–RNA interactions for Protein: P17482

HOXB9, Homeobox protein Hox-B9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB9P17482 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXB9P17482 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXB9P17482 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXB9P17482 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXB9P17482 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXB9P17482 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXB9P17482 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXB9P17482 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXB9P17482 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXB9P17482 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXB9P17482 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXB9P17482 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXB9P17482 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXB9P17482 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXB9P17482 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXB9P17482 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXB9P17482 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXB9P17482 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXB9P17482 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXB9P17482 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXB9P17482 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXB9P17482 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXB9P17482 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXB9P17482 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXB9P17482 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXB9P17482 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXB9P17482 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXB9P17482 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXB9P17482 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXB9P17482 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXB9P17482 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXB9P17482 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXB9P17482 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXB9P17482 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXB9P17482 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXB9P17482 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXB9P17482 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXB9P17482 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXB9P17482 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXB9P17482 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXB9P17482 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXB9P17482 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXB9P17482 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXB9P17482 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXB9P17482 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXB9P17482 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXB9P17482 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXB9P17482 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXB9P17482 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXB9P17482 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXB9P17482 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXB9P17482 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXB9P17482 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXB9P17482 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXB9P17482 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXB9P17482 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXB9P17482 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXB9P17482 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXB9P17482 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXB9P17482 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXB9P17482 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXB9P17482 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXB9P17482 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXB9P17482 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXB9P17482 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXB9P17482 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXB9P17482 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXB9P17482 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
HOXB9P17482 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
HOXB9P17482 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
HOXB9P17482 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
HOXB9P17482 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.1
HOXB9P17482 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXB9P17482 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXB9P17482 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXB9P17482 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXB9P17482 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXB9P17482 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXB9P17482 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXB9P17482 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXB9P17482 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXB9P17482 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXB9P17482 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXB9P17482 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXB9P17482 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXB9P17482 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXB9P17482 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXB9P17482 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXB9P17482 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXB9P17482 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXB9P17482 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXB9P17482 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXB9P17482 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXB9P17482 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXB9P17482 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXB9P17482 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXB9P17482 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXB9P17482 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXB9P17482 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXB9P17482 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms