Protein–RNA interactions for Protein: P15924

DSP, Desmoplakin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,871 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSPP15924 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DSPP15924 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
DSPP15924 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DSPP15924 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DSPP15924 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DSPP15924 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DSPP15924 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DSPP15924 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DSPP15924 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DSPP15924 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DSPP15924 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DSPP15924 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DSPP15924 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DSPP15924 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
DSPP15924 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DSPP15924 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DSPP15924 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DSPP15924 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DSPP15924 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DSPP15924 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DSPP15924 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DSPP15924 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DSPP15924 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DSPP15924 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DSPP15924 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DSPP15924 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DSPP15924 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
DSPP15924 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
DSPP15924 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DSPP15924 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DSPP15924 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DSPP15924 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DSPP15924 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DSPP15924 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DSPP15924 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DSPP15924 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DSPP15924 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DSPP15924 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DSPP15924 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DSPP15924 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
DSPP15924 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
DSPP15924 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DSPP15924 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DSPP15924 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DSPP15924 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DSPP15924 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DSPP15924 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DSPP15924 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DSPP15924 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DSPP15924 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DSPP15924 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DSPP15924 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DSPP15924 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DSPP15924 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DSPP15924 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DSPP15924 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
DSPP15924 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DSPP15924 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DSPP15924 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DSPP15924 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DSPP15924 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DSPP15924 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DSPP15924 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DSPP15924 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DSPP15924 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DSPP15924 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DSPP15924 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DSPP15924 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
DSPP15924 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DSPP15924 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DSPP15924 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DSPP15924 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DSPP15924 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
DSPP15924 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
DSPP15924 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
DSPP15924 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DSPP15924 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DSPP15924 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DSPP15924 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DSPP15924 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DSPP15924 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DSPP15924 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DSPP15924 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DSPP15924 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
DSPP15924 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DSPP15924 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DSPP15924 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DSPP15924 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DSPP15924 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DSPP15924 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DSPP15924 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DSPP15924 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DSPP15924 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DSPP15924 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
DSPP15924 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DSPP15924 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DSPP15924 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DSPP15924 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DSPP15924 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DSPP15924 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms