Protein–RNA interactions for Protein: P13500

CCL2, C-C motif chemokine 2, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL2P13500 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCL2P13500 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCL2P13500 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCL2P13500 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCL2P13500 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCL2P13500 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCL2P13500 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCL2P13500 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CCL2P13500 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCL2P13500 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCL2P13500 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CCL2P13500 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCL2P13500 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCL2P13500 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCL2P13500 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCL2P13500 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CCL2P13500 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCL2P13500 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCL2P13500 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCL2P13500 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCL2P13500 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCL2P13500 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCL2P13500 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCL2P13500 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCL2P13500 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCL2P13500 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCL2P13500 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CCL2P13500 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
CCL2P13500 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
CCL2P13500 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CCL2P13500 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
CCL2P13500 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CCL2P13500 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CCL2P13500 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CCL2P13500 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
CCL2P13500 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
CCL2P13500 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CCL2P13500 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CCL2P13500 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CCL2P13500 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CCL2P13500 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CCL2P13500 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CCL2P13500 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CCL2P13500 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CCL2P13500 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CCL2P13500 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CCL2P13500 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CCL2P13500 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CCL2P13500 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CCL2P13500 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CCL2P13500 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CCL2P13500 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CCL2P13500 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CCL2P13500 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CCL2P13500 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CCL2P13500 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CCL2P13500 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CCL2P13500 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CCL2P13500 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CCL2P13500 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CCL2P13500 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CCL2P13500 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CCL2P13500 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CCL2P13500 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CCL2P13500 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CCL2P13500 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CCL2P13500 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CCL2P13500 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CCL2P13500 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CCL2P13500 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCL2P13500 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCL2P13500 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCL2P13500 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCL2P13500 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCL2P13500 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCL2P13500 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCL2P13500 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCL2P13500 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCL2P13500 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCL2P13500 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCL2P13500 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCL2P13500 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCL2P13500 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCL2P13500 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCL2P13500 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCL2P13500 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCL2P13500 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCL2P13500 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCL2P13500 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCL2P13500 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCL2P13500 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCL2P13500 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCL2P13500 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCL2P13500 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCL2P13500 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
CCL2P13500 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
CCL2P13500 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
CCL2P13500 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCL2P13500 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCL2P13500 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms