Protein–RNA interactions for Protein: P12644

BMP4, Bone morphogenetic protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMP4P12644 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BMP4P12644 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BMP4P12644 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
BMP4P12644 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BMP4P12644 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BMP4P12644 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BMP4P12644 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BMP4P12644 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
BMP4P12644 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BMP4P12644 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BMP4P12644 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BMP4P12644 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BMP4P12644 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BMP4P12644 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
BMP4P12644 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BMP4P12644 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BMP4P12644 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BMP4P12644 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BMP4P12644 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BMP4P12644 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BMP4P12644 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BMP4P12644 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BMP4P12644 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BMP4P12644 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BMP4P12644 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BMP4P12644 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BMP4P12644 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BMP4P12644 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BMP4P12644 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BMP4P12644 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BMP4P12644 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BMP4P12644 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BMP4P12644 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BMP4P12644 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BMP4P12644 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
BMP4P12644 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BMP4P12644 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
BMP4P12644 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BMP4P12644 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BMP4P12644 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BMP4P12644 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BMP4P12644 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BMP4P12644 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BMP4P12644 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BMP4P12644 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BMP4P12644 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BMP4P12644 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BMP4P12644 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BMP4P12644 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BMP4P12644 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BMP4P12644 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BMP4P12644 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BMP4P12644 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BMP4P12644 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BMP4P12644 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BMP4P12644 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BMP4P12644 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BMP4P12644 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BMP4P12644 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BMP4P12644 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BMP4P12644 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BMP4P12644 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
BMP4P12644 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BMP4P12644 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BMP4P12644 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BMP4P12644 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BMP4P12644 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BMP4P12644 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BMP4P12644 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BMP4P12644 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BMP4P12644 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BMP4P12644 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BMP4P12644 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BMP4P12644 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BMP4P12644 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BMP4P12644 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BMP4P12644 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BMP4P12644 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BMP4P12644 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BMP4P12644 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BMP4P12644 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BMP4P12644 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BMP4P12644 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BMP4P12644 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BMP4P12644 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BMP4P12644 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BMP4P12644 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BMP4P12644 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BMP4P12644 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BMP4P12644 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BMP4P12644 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BMP4P12644 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BMP4P12644 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BMP4P12644 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BMP4P12644 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BMP4P12644 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
BMP4P12644 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BMP4P12644 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BMP4P12644 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
BMP4P12644 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms