Protein–RNA interactions for Protein: P12271

RLBP1, Retinaldehyde-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLBP1P12271 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RLBP1P12271 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RLBP1P12271 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RLBP1P12271 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RLBP1P12271 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RLBP1P12271 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RLBP1P12271 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RLBP1P12271 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RLBP1P12271 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RLBP1P12271 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
RLBP1P12271 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RLBP1P12271 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RLBP1P12271 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RLBP1P12271 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RLBP1P12271 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RLBP1P12271 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
RLBP1P12271 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
RLBP1P12271 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RLBP1P12271 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RLBP1P12271 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RLBP1P12271 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RLBP1P12271 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RLBP1P12271 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RLBP1P12271 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RLBP1P12271 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RLBP1P12271 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RLBP1P12271 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RLBP1P12271 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RLBP1P12271 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RLBP1P12271 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RLBP1P12271 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RLBP1P12271 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RLBP1P12271 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RLBP1P12271 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RLBP1P12271 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RLBP1P12271 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RLBP1P12271 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RLBP1P12271 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RLBP1P12271 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RLBP1P12271 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RLBP1P12271 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RLBP1P12271 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RLBP1P12271 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RLBP1P12271 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RLBP1P12271 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RLBP1P12271 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RLBP1P12271 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RLBP1P12271 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
RLBP1P12271 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
RLBP1P12271 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RLBP1P12271 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RLBP1P12271 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RLBP1P12271 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RLBP1P12271 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RLBP1P12271 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
RLBP1P12271 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RLBP1P12271 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RLBP1P12271 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RLBP1P12271 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RLBP1P12271 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RLBP1P12271 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RLBP1P12271 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RLBP1P12271 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RLBP1P12271 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RLBP1P12271 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
RLBP1P12271 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RLBP1P12271 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RLBP1P12271 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RLBP1P12271 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
RLBP1P12271 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RLBP1P12271 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RLBP1P12271 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RLBP1P12271 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RLBP1P12271 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RLBP1P12271 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RLBP1P12271 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RLBP1P12271 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
RLBP1P12271 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
RLBP1P12271 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RLBP1P12271 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RLBP1P12271 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RLBP1P12271 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
RLBP1P12271 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
RLBP1P12271 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RLBP1P12271 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RLBP1P12271 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RLBP1P12271 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RLBP1P12271 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RLBP1P12271 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RLBP1P12271 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RLBP1P12271 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RLBP1P12271 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RLBP1P12271 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RLBP1P12271 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RLBP1P12271 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RLBP1P12271 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RLBP1P12271 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RLBP1P12271 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RLBP1P12271 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RLBP1P12271 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms