Protein–RNA interactions for Protein: P10071

GLI3, Transcriptional activator GLI3, humanhuman

Predictions only

Length 1,580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI3P10071 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GLI3P10071 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GLI3P10071 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GLI3P10071 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GLI3P10071 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GLI3P10071 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
GLI3P10071 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GLI3P10071 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GLI3P10071 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GLI3P10071 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GLI3P10071 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GLI3P10071 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GLI3P10071 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GLI3P10071 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GLI3P10071 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GLI3P10071 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GLI3P10071 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GLI3P10071 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GLI3P10071 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GLI3P10071 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GLI3P10071 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
GLI3P10071 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GLI3P10071 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GLI3P10071 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GLI3P10071 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GLI3P10071 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GLI3P10071 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GLI3P10071 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GLI3P10071 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GLI3P10071 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GLI3P10071 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GLI3P10071 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GLI3P10071 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GLI3P10071 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GLI3P10071 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
GLI3P10071 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GLI3P10071 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GLI3P10071 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GLI3P10071 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GLI3P10071 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GLI3P10071 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GLI3P10071 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GLI3P10071 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GLI3P10071 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GLI3P10071 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GLI3P10071 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GLI3P10071 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GLI3P10071 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GLI3P10071 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GLI3P10071 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
GLI3P10071 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GLI3P10071 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GLI3P10071 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GLI3P10071 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GLI3P10071 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GLI3P10071 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GLI3P10071 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GLI3P10071 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
GLI3P10071 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GLI3P10071 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GLI3P10071 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GLI3P10071 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GLI3P10071 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GLI3P10071 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GLI3P10071 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GLI3P10071 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GLI3P10071 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GLI3P10071 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GLI3P10071 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GLI3P10071 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GLI3P10071 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GLI3P10071 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GLI3P10071 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GLI3P10071 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GLI3P10071 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GLI3P10071 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GLI3P10071 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GLI3P10071 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
GLI3P10071 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GLI3P10071 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
GLI3P10071 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GLI3P10071 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GLI3P10071 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
GLI3P10071 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
GLI3P10071 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
GLI3P10071 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GLI3P10071 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GLI3P10071 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GLI3P10071 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GLI3P10071 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GLI3P10071 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GLI3P10071 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GLI3P10071 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GLI3P10071 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
GLI3P10071 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
GLI3P10071 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
GLI3P10071 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GLI3P10071 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GLI3P10071 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GLI3P10071 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms