Protein–RNA interactions for Protein: P0C843

LINC00032, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00032, humanhuman

Predictions only

Length 101 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00032P0C843 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00032P0C843 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00032P0C843 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00032P0C843 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00032P0C843 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00032P0C843 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00032P0C843 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00032P0C843 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00032P0C843 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00032P0C843 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00032P0C843 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00032P0C843 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00032P0C843 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00032P0C843 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00032P0C843 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00032P0C843 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00032P0C843 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00032P0C843 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00032P0C843 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00032P0C843 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00032P0C843 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00032P0C843 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00032P0C843 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00032P0C843 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00032P0C843 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00032P0C843 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00032P0C843 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00032P0C843 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00032P0C843 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00032P0C843 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00032P0C843 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00032P0C843 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00032P0C843 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00032P0C843 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00032P0C843 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00032P0C843 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00032P0C843 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00032P0C843 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00032P0C843 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00032P0C843 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00032P0C843 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00032P0C843 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00032P0C843 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00032P0C843 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00032P0C843 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00032P0C843 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00032P0C843 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00032P0C843 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00032P0C843 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00032P0C843 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00032P0C843 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00032P0C843 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00032P0C843 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00032P0C843 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00032P0C843 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00032P0C843 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00032P0C843 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00032P0C843 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00032P0C843 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00032P0C843 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00032P0C843 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00032P0C843 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00032P0C843 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00032P0C843 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00032P0C843 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00032P0C843 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00032P0C843 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00032P0C843 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00032P0C843 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00032P0C843 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00032P0C843 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00032P0C843 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00032P0C843 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00032P0C843 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00032P0C843 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00032P0C843 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00032P0C843 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00032P0C843 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00032P0C843 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00032P0C843 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00032P0C843 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00032P0C843 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00032P0C843 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00032P0C843 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00032P0C843 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00032P0C843 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00032P0C843 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00032P0C843 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00032P0C843 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00032P0C843 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00032P0C843 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00032P0C843 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00032P0C843 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00032P0C843 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00032P0C843 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00032P0C843 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00032P0C843 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00032P0C843 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00032P0C843 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00032P0C843 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms