Protein–RNA interactions for Protein: P04839

CYBB, Cytochrome b-245 heavy chain, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYBBP04839 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CYBBP04839 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CYBBP04839 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CYBBP04839 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CYBBP04839 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CYBBP04839 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CYBBP04839 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CYBBP04839 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CYBBP04839 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CYBBP04839 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CYBBP04839 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CYBBP04839 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CYBBP04839 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CYBBP04839 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CYBBP04839 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CYBBP04839 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CYBBP04839 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CYBBP04839 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CYBBP04839 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CYBBP04839 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CYBBP04839 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CYBBP04839 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CYBBP04839 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CYBBP04839 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CYBBP04839 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CYBBP04839 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CYBBP04839 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CYBBP04839 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CYBBP04839 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CYBBP04839 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CYBBP04839 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CYBBP04839 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CYBBP04839 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CYBBP04839 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CYBBP04839 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CYBBP04839 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CYBBP04839 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CYBBP04839 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CYBBP04839 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CYBBP04839 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CYBBP04839 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CYBBP04839 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CYBBP04839 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CYBBP04839 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CYBBP04839 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CYBBP04839 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CYBBP04839 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CYBBP04839 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CYBBP04839 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CYBBP04839 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CYBBP04839 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CYBBP04839 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CYBBP04839 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CYBBP04839 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CYBBP04839 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CYBBP04839 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CYBBP04839 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CYBBP04839 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CYBBP04839 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CYBBP04839 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CYBBP04839 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CYBBP04839 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CYBBP04839 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CYBBP04839 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CYBBP04839 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CYBBP04839 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CYBBP04839 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CYBBP04839 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CYBBP04839 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CYBBP04839 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CYBBP04839 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CYBBP04839 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CYBBP04839 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CYBBP04839 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CYBBP04839 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CYBBP04839 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CYBBP04839 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CYBBP04839 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CYBBP04839 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CYBBP04839 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CYBBP04839 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CYBBP04839 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CYBBP04839 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CYBBP04839 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CYBBP04839 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CYBBP04839 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CYBBP04839 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CYBBP04839 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CYBBP04839 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CYBBP04839 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CYBBP04839 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CYBBP04839 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CYBBP04839 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CYBBP04839 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CYBBP04839 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CYBBP04839 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CYBBP04839 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CYBBP04839 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CYBBP04839 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CYBBP04839 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms