Protein–RNA interactions for Protein: O75323

NIPSNAP2, Protein NipSnap homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP2O75323 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NIPSNAP2O75323 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NIPSNAP2O75323 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NIPSNAP2O75323 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NIPSNAP2O75323 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NIPSNAP2O75323 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NIPSNAP2O75323 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NIPSNAP2O75323 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NIPSNAP2O75323 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
NIPSNAP2O75323 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NIPSNAP2O75323 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NIPSNAP2O75323 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NIPSNAP2O75323 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NIPSNAP2O75323 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NIPSNAP2O75323 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NIPSNAP2O75323 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NIPSNAP2O75323 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NIPSNAP2O75323 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NIPSNAP2O75323 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
NIPSNAP2O75323 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NIPSNAP2O75323 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NIPSNAP2O75323 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NIPSNAP2O75323 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NIPSNAP2O75323 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NIPSNAP2O75323 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NIPSNAP2O75323 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NIPSNAP2O75323 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NIPSNAP2O75323 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NIPSNAP2O75323 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
NIPSNAP2O75323 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NIPSNAP2O75323 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NIPSNAP2O75323 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NIPSNAP2O75323 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
NIPSNAP2O75323 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NIPSNAP2O75323 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NIPSNAP2O75323 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NIPSNAP2O75323 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NIPSNAP2O75323 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NIPSNAP2O75323 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NIPSNAP2O75323 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NIPSNAP2O75323 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NIPSNAP2O75323 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NIPSNAP2O75323 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NIPSNAP2O75323 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NIPSNAP2O75323 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NIPSNAP2O75323 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NIPSNAP2O75323 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NIPSNAP2O75323 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NIPSNAP2O75323 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NIPSNAP2O75323 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NIPSNAP2O75323 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NIPSNAP2O75323 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NIPSNAP2O75323 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NIPSNAP2O75323 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NIPSNAP2O75323 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NIPSNAP2O75323 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NIPSNAP2O75323 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NIPSNAP2O75323 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NIPSNAP2O75323 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NIPSNAP2O75323 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NIPSNAP2O75323 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NIPSNAP2O75323 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NIPSNAP2O75323 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NIPSNAP2O75323 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NIPSNAP2O75323 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NIPSNAP2O75323 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NIPSNAP2O75323 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NIPSNAP2O75323 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NIPSNAP2O75323 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NIPSNAP2O75323 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NIPSNAP2O75323 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NIPSNAP2O75323 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NIPSNAP2O75323 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NIPSNAP2O75323 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
NIPSNAP2O75323 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NIPSNAP2O75323 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NIPSNAP2O75323 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NIPSNAP2O75323 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NIPSNAP2O75323 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NIPSNAP2O75323 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NIPSNAP2O75323 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NIPSNAP2O75323 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NIPSNAP2O75323 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NIPSNAP2O75323 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NIPSNAP2O75323 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NIPSNAP2O75323 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NIPSNAP2O75323 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
NIPSNAP2O75323 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NIPSNAP2O75323 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NIPSNAP2O75323 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NIPSNAP2O75323 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NIPSNAP2O75323 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NIPSNAP2O75323 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NIPSNAP2O75323 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NIPSNAP2O75323 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NIPSNAP2O75323 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NIPSNAP2O75323 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NIPSNAP2O75323 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms