Protein–RNA interactions for Protein: O60437

PPL, Periplakin, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPLO60437 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PPLO60437 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PPLO60437 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PPLO60437 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PPLO60437 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PPLO60437 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PPLO60437 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PPLO60437 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PPLO60437 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PPLO60437 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PPLO60437 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PPLO60437 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PPLO60437 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PPLO60437 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PPLO60437 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PPLO60437 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PPLO60437 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PPLO60437 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PPLO60437 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PPLO60437 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PPLO60437 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PPLO60437 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PPLO60437 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PPLO60437 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PPLO60437 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PPLO60437 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PPLO60437 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PPLO60437 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PPLO60437 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PPLO60437 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PPLO60437 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PPLO60437 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PPLO60437 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PPLO60437 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
PPLO60437 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PPLO60437 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PPLO60437 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PPLO60437 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PPLO60437 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PPLO60437 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PPLO60437 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PPLO60437 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PPLO60437 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PPLO60437 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PPLO60437 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PPLO60437 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PPLO60437 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PPLO60437 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PPLO60437 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PPLO60437 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PPLO60437 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PPLO60437 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PPLO60437 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PPLO60437 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PPLO60437 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PPLO60437 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PPLO60437 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PPLO60437 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PPLO60437 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PPLO60437 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PPLO60437 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PPLO60437 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PPLO60437 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PPLO60437 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PPLO60437 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PPLO60437 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PPLO60437 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PPLO60437 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PPLO60437 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PPLO60437 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PPLO60437 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PPLO60437 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PPLO60437 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PPLO60437 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PPLO60437 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PPLO60437 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PPLO60437 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PPLO60437 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PPLO60437 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PPLO60437 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PPLO60437 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PPLO60437 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PPLO60437 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PPLO60437 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PPLO60437 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PPLO60437 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PPLO60437 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PPLO60437 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PPLO60437 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PPLO60437 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PPLO60437 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PPLO60437 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PPLO60437 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PPLO60437 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PPLO60437 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PPLO60437 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PPLO60437 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PPLO60437 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PPLO60437 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PPLO60437 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms