Protein–RNA interactions for Protein: C9J3I9

C5orf58, Putative uncharacterized protein C5orf58, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf58C9J3I9 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C5orf58C9J3I9 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C5orf58C9J3I9 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C5orf58C9J3I9 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C5orf58C9J3I9 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C5orf58C9J3I9 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C5orf58C9J3I9 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C5orf58C9J3I9 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C5orf58C9J3I9 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C5orf58C9J3I9 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
C5orf58C9J3I9 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C5orf58C9J3I9 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C5orf58C9J3I9 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C5orf58C9J3I9 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C5orf58C9J3I9 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C5orf58C9J3I9 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C5orf58C9J3I9 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C5orf58C9J3I9 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C5orf58C9J3I9 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C5orf58C9J3I9 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C5orf58C9J3I9 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C5orf58C9J3I9 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C5orf58C9J3I9 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C5orf58C9J3I9 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C5orf58C9J3I9 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C5orf58C9J3I9 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C5orf58C9J3I9 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
C5orf58C9J3I9 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C5orf58C9J3I9 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C5orf58C9J3I9 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C5orf58C9J3I9 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C5orf58C9J3I9 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
C5orf58C9J3I9 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C5orf58C9J3I9 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C5orf58C9J3I9 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
C5orf58C9J3I9 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C5orf58C9J3I9 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C5orf58C9J3I9 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C5orf58C9J3I9 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C5orf58C9J3I9 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C5orf58C9J3I9 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C5orf58C9J3I9 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C5orf58C9J3I9 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C5orf58C9J3I9 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C5orf58C9J3I9 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C5orf58C9J3I9 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C5orf58C9J3I9 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
C5orf58C9J3I9 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C5orf58C9J3I9 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C5orf58C9J3I9 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C5orf58C9J3I9 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C5orf58C9J3I9 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C5orf58C9J3I9 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C5orf58C9J3I9 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C5orf58C9J3I9 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C5orf58C9J3I9 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C5orf58C9J3I9 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C5orf58C9J3I9 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C5orf58C9J3I9 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C5orf58C9J3I9 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
C5orf58C9J3I9 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C5orf58C9J3I9 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C5orf58C9J3I9 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C5orf58C9J3I9 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C5orf58C9J3I9 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C5orf58C9J3I9 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C5orf58C9J3I9 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
C5orf58C9J3I9 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C5orf58C9J3I9 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C5orf58C9J3I9 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C5orf58C9J3I9 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C5orf58C9J3I9 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C5orf58C9J3I9 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
C5orf58C9J3I9 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
C5orf58C9J3I9 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
C5orf58C9J3I9 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C5orf58C9J3I9 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C5orf58C9J3I9 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C5orf58C9J3I9 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C5orf58C9J3I9 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C5orf58C9J3I9 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C5orf58C9J3I9 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C5orf58C9J3I9 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C5orf58C9J3I9 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C5orf58C9J3I9 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C5orf58C9J3I9 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C5orf58C9J3I9 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C5orf58C9J3I9 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C5orf58C9J3I9 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C5orf58C9J3I9 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C5orf58C9J3I9 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C5orf58C9J3I9 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C5orf58C9J3I9 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C5orf58C9J3I9 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C5orf58C9J3I9 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C5orf58C9J3I9 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C5orf58C9J3I9 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C5orf58C9J3I9 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C5orf58C9J3I9 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C5orf58C9J3I9 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms