Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
LINC00587B1AMM8 NLRP7-209ENST00000592784 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
LINC00587B1AMM8 ZNF717-204ENST00000478296 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
LINC00587B1AMM8 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
LINC00587B1AMM8 TXNDC12-201ENST00000371626 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
LINC00587B1AMM8 LPO-203ENST00000421678 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
LINC00587B1AMM8 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
LINC00587B1AMM8 SLC4A7-214ENST00000455077 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
LINC00587B1AMM8 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
LINC00587B1AMM8 CCER1-201ENST00000358859 2962 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
LINC00587B1AMM8 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
LINC00587B1AMM8 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
LINC00587B1AMM8 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
LINC00587B1AMM8 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
LINC00587B1AMM8 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
LINC00587B1AMM8 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
LINC00587B1AMM8 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
LINC00587B1AMM8 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
LINC00587B1AMM8 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
LINC00587B1AMM8 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
LINC00587B1AMM8 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
LINC00587B1AMM8 MYADM-201ENST00000336967 3047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
LINC00587B1AMM8 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
LINC00587B1AMM8 KANK2-205ENST00000589359 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
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LINC00587B1AMM8 CTBP1-AS-201ENST00000625256 3886 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
LINC00587B1AMM8 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
LINC00587B1AMM8 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
LINC00587B1AMM8 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
LINC00587B1AMM8 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
LINC00587B1AMM8 CCHCR1-203ENST00000396268 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
LINC00587B1AMM8 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
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LINC00587B1AMM8 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
LINC00587B1AMM8 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
LINC00587B1AMM8 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.6□□□□□ -0.39
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LINC00587B1AMM8 TRPM4-201ENST00000252826 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
LINC00587B1AMM8 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
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LINC00587B1AMM8 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
LINC00587B1AMM8 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
LINC00587B1AMM8 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
LINC00587B1AMM8 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
LINC00587B1AMM8 PCGF2-202ENST00000611883 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
LINC00587B1AMM8 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
LINC00587B1AMM8 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
LINC00587B1AMM8 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
LINC00587B1AMM8 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
LINC00587B1AMM8 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
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LINC00587B1AMM8 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.59□□□□□ -0.39
LINC00587B1AMM8 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
LINC00587B1AMM8 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
LINC00587B1AMM8 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
LINC00587B1AMM8 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
LINC00587B1AMM8 IGHG3-202ENST00000641136 2751 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
LINC00587B1AMM8 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
LINC00587B1AMM8 RBM15-202ENST00000487146 3316 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
LINC00587B1AMM8 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
LINC00587B1AMM8 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
LINC00587B1AMM8 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
LINC00587B1AMM8 FAM219A-207ENST00000379089 3624 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
LINC00587B1AMM8 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
LINC00587B1AMM8 PRRT3-203ENST00000412055 3761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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