Protein–RNA interactions for Protein: A6NHL2

TUBAL3, Tubulin alpha chain-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBAL3A6NHL2 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TUBAL3A6NHL2 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TUBAL3A6NHL2 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TUBAL3A6NHL2 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TUBAL3A6NHL2 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TUBAL3A6NHL2 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TUBAL3A6NHL2 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TUBAL3A6NHL2 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TUBAL3A6NHL2 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TUBAL3A6NHL2 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TUBAL3A6NHL2 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TUBAL3A6NHL2 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TUBAL3A6NHL2 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TUBAL3A6NHL2 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TUBAL3A6NHL2 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TUBAL3A6NHL2 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TUBAL3A6NHL2 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TUBAL3A6NHL2 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TUBAL3A6NHL2 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TUBAL3A6NHL2 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TUBAL3A6NHL2 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TUBAL3A6NHL2 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TUBAL3A6NHL2 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TUBAL3A6NHL2 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TUBAL3A6NHL2 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TUBAL3A6NHL2 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TUBAL3A6NHL2 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TUBAL3A6NHL2 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TUBAL3A6NHL2 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TUBAL3A6NHL2 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TUBAL3A6NHL2 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TUBAL3A6NHL2 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TUBAL3A6NHL2 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TUBAL3A6NHL2 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TUBAL3A6NHL2 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TUBAL3A6NHL2 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TUBAL3A6NHL2 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TUBAL3A6NHL2 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TUBAL3A6NHL2 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TUBAL3A6NHL2 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TUBAL3A6NHL2 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TUBAL3A6NHL2 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TUBAL3A6NHL2 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TUBAL3A6NHL2 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TUBAL3A6NHL2 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TUBAL3A6NHL2 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TUBAL3A6NHL2 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TUBAL3A6NHL2 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TUBAL3A6NHL2 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TUBAL3A6NHL2 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TUBAL3A6NHL2 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TUBAL3A6NHL2 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TUBAL3A6NHL2 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TUBAL3A6NHL2 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TUBAL3A6NHL2 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TUBAL3A6NHL2 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TUBAL3A6NHL2 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TUBAL3A6NHL2 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TUBAL3A6NHL2 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TUBAL3A6NHL2 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TUBAL3A6NHL2 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TUBAL3A6NHL2 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TUBAL3A6NHL2 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TUBAL3A6NHL2 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
TUBAL3A6NHL2 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TUBAL3A6NHL2 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
TUBAL3A6NHL2 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TUBAL3A6NHL2 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TUBAL3A6NHL2 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
TUBAL3A6NHL2 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
TUBAL3A6NHL2 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TUBAL3A6NHL2 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TUBAL3A6NHL2 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TUBAL3A6NHL2 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TUBAL3A6NHL2 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TUBAL3A6NHL2 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TUBAL3A6NHL2 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
TUBAL3A6NHL2 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TUBAL3A6NHL2 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TUBAL3A6NHL2 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TUBAL3A6NHL2 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TUBAL3A6NHL2 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TUBAL3A6NHL2 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TUBAL3A6NHL2 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TUBAL3A6NHL2 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TUBAL3A6NHL2 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TUBAL3A6NHL2 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TUBAL3A6NHL2 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TUBAL3A6NHL2 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TUBAL3A6NHL2 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TUBAL3A6NHL2 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TUBAL3A6NHL2 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TUBAL3A6NHL2 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TUBAL3A6NHL2 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TUBAL3A6NHL2 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
TUBAL3A6NHL2 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TUBAL3A6NHL2 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TUBAL3A6NHL2 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TUBAL3A6NHL2 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TUBAL3A6NHL2 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms