Protein–RNA interactions for Protein: A6NGB9

WIPF3, WAS/WASL-interacting protein family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WIPF3A6NGB9 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
WIPF3A6NGB9 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
WIPF3A6NGB9 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
WIPF3A6NGB9 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
WIPF3A6NGB9 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
WIPF3A6NGB9 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
WIPF3A6NGB9 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0.01
WIPF3A6NGB9 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
WIPF3A6NGB9 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
WIPF3A6NGB9 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
WIPF3A6NGB9 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
WIPF3A6NGB9 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
WIPF3A6NGB9 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
WIPF3A6NGB9 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
WIPF3A6NGB9 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
WIPF3A6NGB9 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
WIPF3A6NGB9 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
WIPF3A6NGB9 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
WIPF3A6NGB9 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
WIPF3A6NGB9 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
WIPF3A6NGB9 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
WIPF3A6NGB9 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
WIPF3A6NGB9 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
WIPF3A6NGB9 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC15.08■□□□□ 0
WIPF3A6NGB9 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
WIPF3A6NGB9 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
WIPF3A6NGB9 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
WIPF3A6NGB9 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC15.08■□□□□ 0
WIPF3A6NGB9 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
WIPF3A6NGB9 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
WIPF3A6NGB9 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
WIPF3A6NGB9 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
WIPF3A6NGB9 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
WIPF3A6NGB9 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
WIPF3A6NGB9 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
WIPF3A6NGB9 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
WIPF3A6NGB9 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
WIPF3A6NGB9 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
WIPF3A6NGB9 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.07■□□□□ 0
WIPF3A6NGB9 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
WIPF3A6NGB9 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
WIPF3A6NGB9 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
WIPF3A6NGB9 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
WIPF3A6NGB9 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
WIPF3A6NGB9 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
WIPF3A6NGB9 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
WIPF3A6NGB9 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
WIPF3A6NGB9 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
WIPF3A6NGB9 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
WIPF3A6NGB9 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
WIPF3A6NGB9 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
WIPF3A6NGB9 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
WIPF3A6NGB9 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
WIPF3A6NGB9 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
WIPF3A6NGB9 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
WIPF3A6NGB9 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
WIPF3A6NGB9 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
WIPF3A6NGB9 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
WIPF3A6NGB9 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
WIPF3A6NGB9 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
WIPF3A6NGB9 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
WIPF3A6NGB9 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
WIPF3A6NGB9 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
WIPF3A6NGB9 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC15.07■□□□□ 0
WIPF3A6NGB9 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
WIPF3A6NGB9 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC15.07■□□□□ 0
WIPF3A6NGB9 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
WIPF3A6NGB9 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.07■□□□□ 0
WIPF3A6NGB9 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
WIPF3A6NGB9 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
WIPF3A6NGB9 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
WIPF3A6NGB9 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
WIPF3A6NGB9 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
WIPF3A6NGB9 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
WIPF3A6NGB9 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
WIPF3A6NGB9 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
WIPF3A6NGB9 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
WIPF3A6NGB9 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
WIPF3A6NGB9 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
WIPF3A6NGB9 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
WIPF3A6NGB9 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
WIPF3A6NGB9 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
WIPF3A6NGB9 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
WIPF3A6NGB9 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
WIPF3A6NGB9 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
WIPF3A6NGB9 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
WIPF3A6NGB9 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
WIPF3A6NGB9 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
WIPF3A6NGB9 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
WIPF3A6NGB9 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
WIPF3A6NGB9 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
WIPF3A6NGB9 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
WIPF3A6NGB9 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
WIPF3A6NGB9 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
WIPF3A6NGB9 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
WIPF3A6NGB9 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
WIPF3A6NGB9 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
WIPF3A6NGB9 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
WIPF3A6NGB9 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
WIPF3A6NGB9 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms