Protein–RNA interactions for Protein: A4UGR9

XIRP2, Xin actin-binding repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 3,374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XIRP2A4UGR9 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
XIRP2A4UGR9 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
XIRP2A4UGR9 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
XIRP2A4UGR9 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
XIRP2A4UGR9 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
XIRP2A4UGR9 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
XIRP2A4UGR9 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
XIRP2A4UGR9 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
XIRP2A4UGR9 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
XIRP2A4UGR9 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
XIRP2A4UGR9 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
XIRP2A4UGR9 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
XIRP2A4UGR9 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
XIRP2A4UGR9 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
XIRP2A4UGR9 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
XIRP2A4UGR9 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
XIRP2A4UGR9 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
XIRP2A4UGR9 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
XIRP2A4UGR9 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
XIRP2A4UGR9 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
XIRP2A4UGR9 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
XIRP2A4UGR9 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
XIRP2A4UGR9 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
XIRP2A4UGR9 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
XIRP2A4UGR9 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
XIRP2A4UGR9 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
XIRP2A4UGR9 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
XIRP2A4UGR9 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
XIRP2A4UGR9 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
XIRP2A4UGR9 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
XIRP2A4UGR9 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
XIRP2A4UGR9 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
XIRP2A4UGR9 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
XIRP2A4UGR9 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
XIRP2A4UGR9 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
XIRP2A4UGR9 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
XIRP2A4UGR9 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
XIRP2A4UGR9 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
XIRP2A4UGR9 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
XIRP2A4UGR9 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
XIRP2A4UGR9 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
XIRP2A4UGR9 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
XIRP2A4UGR9 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
XIRP2A4UGR9 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
XIRP2A4UGR9 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
XIRP2A4UGR9 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
XIRP2A4UGR9 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
XIRP2A4UGR9 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
XIRP2A4UGR9 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
XIRP2A4UGR9 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
XIRP2A4UGR9 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
XIRP2A4UGR9 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
XIRP2A4UGR9 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
XIRP2A4UGR9 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
XIRP2A4UGR9 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
XIRP2A4UGR9 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
XIRP2A4UGR9 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
XIRP2A4UGR9 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
XIRP2A4UGR9 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
XIRP2A4UGR9 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
XIRP2A4UGR9 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
XIRP2A4UGR9 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
XIRP2A4UGR9 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
XIRP2A4UGR9 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
XIRP2A4UGR9 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
XIRP2A4UGR9 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
XIRP2A4UGR9 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
XIRP2A4UGR9 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
XIRP2A4UGR9 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
XIRP2A4UGR9 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
XIRP2A4UGR9 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
XIRP2A4UGR9 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
XIRP2A4UGR9 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
XIRP2A4UGR9 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
XIRP2A4UGR9 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
XIRP2A4UGR9 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
XIRP2A4UGR9 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
XIRP2A4UGR9 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
XIRP2A4UGR9 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
XIRP2A4UGR9 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
XIRP2A4UGR9 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
XIRP2A4UGR9 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
XIRP2A4UGR9 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
XIRP2A4UGR9 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
XIRP2A4UGR9 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
XIRP2A4UGR9 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
XIRP2A4UGR9 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
XIRP2A4UGR9 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
XIRP2A4UGR9 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
XIRP2A4UGR9 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
XIRP2A4UGR9 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
XIRP2A4UGR9 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
XIRP2A4UGR9 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
XIRP2A4UGR9 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
XIRP2A4UGR9 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
XIRP2A4UGR9 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
XIRP2A4UGR9 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
XIRP2A4UGR9 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
XIRP2A4UGR9 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
XIRP2A4UGR9 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.6 ms