Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4D7

PLXND1, Plexin-D1, humanhuman

Predictions only

Length 1,925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXND1Q9Y4D7 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PLXND1Q9Y4D7 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PLXND1Q9Y4D7 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PLXND1Q9Y4D7 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PLXND1Q9Y4D7 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PLXND1Q9Y4D7 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PLXND1Q9Y4D7 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PLXND1Q9Y4D7 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PLXND1Q9Y4D7 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PLXND1Q9Y4D7 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PLXND1Q9Y4D7 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PLXND1Q9Y4D7 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PLXND1Q9Y4D7 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PLXND1Q9Y4D7 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PLXND1Q9Y4D7 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PLXND1Q9Y4D7 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PLXND1Q9Y4D7 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PLXND1Q9Y4D7 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PLXND1Q9Y4D7 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PLXND1Q9Y4D7 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PLXND1Q9Y4D7 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PLXND1Q9Y4D7 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PLXND1Q9Y4D7 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PLXND1Q9Y4D7 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PLXND1Q9Y4D7 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PLXND1Q9Y4D7 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PLXND1Q9Y4D7 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PLXND1Q9Y4D7 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PLXND1Q9Y4D7 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PLXND1Q9Y4D7 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PLXND1Q9Y4D7 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PLXND1Q9Y4D7 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PLXND1Q9Y4D7 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PLXND1Q9Y4D7 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PLXND1Q9Y4D7 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PLXND1Q9Y4D7 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PLXND1Q9Y4D7 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PLXND1Q9Y4D7 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PLXND1Q9Y4D7 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PLXND1Q9Y4D7 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PLXND1Q9Y4D7 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PLXND1Q9Y4D7 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PLXND1Q9Y4D7 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PLXND1Q9Y4D7 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PLXND1Q9Y4D7 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PLXND1Q9Y4D7 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PLXND1Q9Y4D7 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PLXND1Q9Y4D7 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PLXND1Q9Y4D7 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PLXND1Q9Y4D7 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PLXND1Q9Y4D7 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PLXND1Q9Y4D7 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PLXND1Q9Y4D7 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PLXND1Q9Y4D7 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PLXND1Q9Y4D7 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PLXND1Q9Y4D7 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PLXND1Q9Y4D7 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PLXND1Q9Y4D7 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PLXND1Q9Y4D7 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PLXND1Q9Y4D7 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PLXND1Q9Y4D7 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PLXND1Q9Y4D7 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PLXND1Q9Y4D7 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PLXND1Q9Y4D7 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PLXND1Q9Y4D7 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PLXND1Q9Y4D7 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PLXND1Q9Y4D7 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PLXND1Q9Y4D7 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PLXND1Q9Y4D7 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PLXND1Q9Y4D7 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PLXND1Q9Y4D7 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PLXND1Q9Y4D7 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PLXND1Q9Y4D7 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PLXND1Q9Y4D7 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PLXND1Q9Y4D7 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PLXND1Q9Y4D7 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PLXND1Q9Y4D7 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PLXND1Q9Y4D7 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PLXND1Q9Y4D7 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PLXND1Q9Y4D7 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PLXND1Q9Y4D7 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PLXND1Q9Y4D7 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PLXND1Q9Y4D7 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PLXND1Q9Y4D7 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PLXND1Q9Y4D7 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PLXND1Q9Y4D7 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PLXND1Q9Y4D7 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PLXND1Q9Y4D7 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PLXND1Q9Y4D7 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PLXND1Q9Y4D7 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PLXND1Q9Y4D7 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PLXND1Q9Y4D7 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PLXND1Q9Y4D7 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PLXND1Q9Y4D7 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PLXND1Q9Y4D7 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PLXND1Q9Y4D7 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PLXND1Q9Y4D7 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PLXND1Q9Y4D7 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PLXND1Q9Y4D7 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PLXND1Q9Y4D7 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms