Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E1

HDGFL3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3Q9Y3E1 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HDGFL3Q9Y3E1 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HDGFL3Q9Y3E1 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HDGFL3Q9Y3E1 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HDGFL3Q9Y3E1 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HDGFL3Q9Y3E1 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HDGFL3Q9Y3E1 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HDGFL3Q9Y3E1 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HDGFL3Q9Y3E1 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HDGFL3Q9Y3E1 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HDGFL3Q9Y3E1 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HDGFL3Q9Y3E1 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HDGFL3Q9Y3E1 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HDGFL3Q9Y3E1 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
HDGFL3Q9Y3E1 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HDGFL3Q9Y3E1 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
HDGFL3Q9Y3E1 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
HDGFL3Q9Y3E1 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HDGFL3Q9Y3E1 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
HDGFL3Q9Y3E1 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HDGFL3Q9Y3E1 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HDGFL3Q9Y3E1 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
HDGFL3Q9Y3E1 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HDGFL3Q9Y3E1 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HDGFL3Q9Y3E1 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HDGFL3Q9Y3E1 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
HDGFL3Q9Y3E1 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HDGFL3Q9Y3E1 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HDGFL3Q9Y3E1 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HDGFL3Q9Y3E1 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HDGFL3Q9Y3E1 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HDGFL3Q9Y3E1 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HDGFL3Q9Y3E1 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HDGFL3Q9Y3E1 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HDGFL3Q9Y3E1 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HDGFL3Q9Y3E1 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HDGFL3Q9Y3E1 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HDGFL3Q9Y3E1 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HDGFL3Q9Y3E1 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HDGFL3Q9Y3E1 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
HDGFL3Q9Y3E1 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HDGFL3Q9Y3E1 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HDGFL3Q9Y3E1 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HDGFL3Q9Y3E1 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.03■□□□□ -0
HDGFL3Q9Y3E1 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HDGFL3Q9Y3E1 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HDGFL3Q9Y3E1 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HDGFL3Q9Y3E1 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
HDGFL3Q9Y3E1 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HDGFL3Q9Y3E1 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HDGFL3Q9Y3E1 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HDGFL3Q9Y3E1 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HDGFL3Q9Y3E1 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.03■□□□□ -0
HDGFL3Q9Y3E1 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HDGFL3Q9Y3E1 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
HDGFL3Q9Y3E1 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
HDGFL3Q9Y3E1 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
HDGFL3Q9Y3E1 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
HDGFL3Q9Y3E1 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HDGFL3Q9Y3E1 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
HDGFL3Q9Y3E1 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
HDGFL3Q9Y3E1 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC15.03■□□□□ -0
HDGFL3Q9Y3E1 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.03■□□□□ -0
HDGFL3Q9Y3E1 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC15.03■□□□□ -0
HDGFL3Q9Y3E1 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.03■□□□□ -0
HDGFL3Q9Y3E1 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HDGFL3Q9Y3E1 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HDGFL3Q9Y3E1 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HDGFL3Q9Y3E1 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HDGFL3Q9Y3E1 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HDGFL3Q9Y3E1 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HDGFL3Q9Y3E1 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HDGFL3Q9Y3E1 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HDGFL3Q9Y3E1 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HDGFL3Q9Y3E1 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HDGFL3Q9Y3E1 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HDGFL3Q9Y3E1 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HDGFL3Q9Y3E1 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.03■□□□□ -0
HDGFL3Q9Y3E1 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HDGFL3Q9Y3E1 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
HDGFL3Q9Y3E1 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HDGFL3Q9Y3E1 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HDGFL3Q9Y3E1 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HDGFL3Q9Y3E1 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
HDGFL3Q9Y3E1 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
HDGFL3Q9Y3E1 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HDGFL3Q9Y3E1 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HDGFL3Q9Y3E1 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HDGFL3Q9Y3E1 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HDGFL3Q9Y3E1 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HDGFL3Q9Y3E1 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HDGFL3Q9Y3E1 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HDGFL3Q9Y3E1 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HDGFL3Q9Y3E1 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
HDGFL3Q9Y3E1 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HDGFL3Q9Y3E1 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
HDGFL3Q9Y3E1 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
HDGFL3Q9Y3E1 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.1 ms