Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIA0

CYTH4, Cytohesin-4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH4Q9UIA0 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CYTH4Q9UIA0 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CYTH4Q9UIA0 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CYTH4Q9UIA0 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CYTH4Q9UIA0 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CYTH4Q9UIA0 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CYTH4Q9UIA0 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CYTH4Q9UIA0 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CYTH4Q9UIA0 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CYTH4Q9UIA0 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CYTH4Q9UIA0 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CYTH4Q9UIA0 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CYTH4Q9UIA0 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CYTH4Q9UIA0 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CYTH4Q9UIA0 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CYTH4Q9UIA0 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CYTH4Q9UIA0 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CYTH4Q9UIA0 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CYTH4Q9UIA0 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CYTH4Q9UIA0 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CYTH4Q9UIA0 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CYTH4Q9UIA0 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CYTH4Q9UIA0 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CYTH4Q9UIA0 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CYTH4Q9UIA0 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CYTH4Q9UIA0 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CYTH4Q9UIA0 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CYTH4Q9UIA0 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CYTH4Q9UIA0 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CYTH4Q9UIA0 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CYTH4Q9UIA0 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CYTH4Q9UIA0 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CYTH4Q9UIA0 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CYTH4Q9UIA0 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CYTH4Q9UIA0 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CYTH4Q9UIA0 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CYTH4Q9UIA0 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CYTH4Q9UIA0 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CYTH4Q9UIA0 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CYTH4Q9UIA0 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CYTH4Q9UIA0 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CYTH4Q9UIA0 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CYTH4Q9UIA0 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CYTH4Q9UIA0 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CYTH4Q9UIA0 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CYTH4Q9UIA0 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CYTH4Q9UIA0 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CYTH4Q9UIA0 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CYTH4Q9UIA0 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CYTH4Q9UIA0 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CYTH4Q9UIA0 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CYTH4Q9UIA0 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CYTH4Q9UIA0 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CYTH4Q9UIA0 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CYTH4Q9UIA0 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CYTH4Q9UIA0 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CYTH4Q9UIA0 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CYTH4Q9UIA0 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CYTH4Q9UIA0 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CYTH4Q9UIA0 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CYTH4Q9UIA0 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CYTH4Q9UIA0 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CYTH4Q9UIA0 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CYTH4Q9UIA0 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CYTH4Q9UIA0 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CYTH4Q9UIA0 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CYTH4Q9UIA0 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CYTH4Q9UIA0 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CYTH4Q9UIA0 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CYTH4Q9UIA0 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CYTH4Q9UIA0 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CYTH4Q9UIA0 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CYTH4Q9UIA0 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CYTH4Q9UIA0 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CYTH4Q9UIA0 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CYTH4Q9UIA0 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CYTH4Q9UIA0 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CYTH4Q9UIA0 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CYTH4Q9UIA0 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CYTH4Q9UIA0 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CYTH4Q9UIA0 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CYTH4Q9UIA0 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CYTH4Q9UIA0 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CYTH4Q9UIA0 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CYTH4Q9UIA0 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CYTH4Q9UIA0 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CYTH4Q9UIA0 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CYTH4Q9UIA0 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CYTH4Q9UIA0 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CYTH4Q9UIA0 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CYTH4Q9UIA0 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CYTH4Q9UIA0 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CYTH4Q9UIA0 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CYTH4Q9UIA0 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CYTH4Q9UIA0 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CYTH4Q9UIA0 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CYTH4Q9UIA0 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CYTH4Q9UIA0 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CYTH4Q9UIA0 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CYTH4Q9UIA0 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms