Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHV7

MED13, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 13, humanhuman

Predictions only

Length 2,174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED13Q9UHV7 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
MED13Q9UHV7 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MED13Q9UHV7 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
MED13Q9UHV7 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MED13Q9UHV7 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MED13Q9UHV7 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
MED13Q9UHV7 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MED13Q9UHV7 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MED13Q9UHV7 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MED13Q9UHV7 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MED13Q9UHV7 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MED13Q9UHV7 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MED13Q9UHV7 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MED13Q9UHV7 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MED13Q9UHV7 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MED13Q9UHV7 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MED13Q9UHV7 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MED13Q9UHV7 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MED13Q9UHV7 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MED13Q9UHV7 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MED13Q9UHV7 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MED13Q9UHV7 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MED13Q9UHV7 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MED13Q9UHV7 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MED13Q9UHV7 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MED13Q9UHV7 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MED13Q9UHV7 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MED13Q9UHV7 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MED13Q9UHV7 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
MED13Q9UHV7 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MED13Q9UHV7 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MED13Q9UHV7 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MED13Q9UHV7 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MED13Q9UHV7 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MED13Q9UHV7 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MED13Q9UHV7 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MED13Q9UHV7 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MED13Q9UHV7 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MED13Q9UHV7 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MED13Q9UHV7 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MED13Q9UHV7 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MED13Q9UHV7 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MED13Q9UHV7 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MED13Q9UHV7 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MED13Q9UHV7 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MED13Q9UHV7 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MED13Q9UHV7 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
MED13Q9UHV7 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MED13Q9UHV7 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MED13Q9UHV7 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MED13Q9UHV7 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MED13Q9UHV7 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MED13Q9UHV7 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MED13Q9UHV7 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MED13Q9UHV7 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MED13Q9UHV7 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MED13Q9UHV7 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MED13Q9UHV7 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MED13Q9UHV7 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MED13Q9UHV7 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MED13Q9UHV7 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MED13Q9UHV7 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MED13Q9UHV7 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MED13Q9UHV7 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MED13Q9UHV7 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MED13Q9UHV7 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
MED13Q9UHV7 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MED13Q9UHV7 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MED13Q9UHV7 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MED13Q9UHV7 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
MED13Q9UHV7 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MED13Q9UHV7 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MED13Q9UHV7 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MED13Q9UHV7 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
MED13Q9UHV7 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MED13Q9UHV7 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MED13Q9UHV7 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MED13Q9UHV7 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MED13Q9UHV7 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MED13Q9UHV7 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MED13Q9UHV7 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MED13Q9UHV7 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MED13Q9UHV7 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MED13Q9UHV7 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MED13Q9UHV7 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
MED13Q9UHV7 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MED13Q9UHV7 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MED13Q9UHV7 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MED13Q9UHV7 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MED13Q9UHV7 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MED13Q9UHV7 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
MED13Q9UHV7 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MED13Q9UHV7 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MED13Q9UHV7 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MED13Q9UHV7 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MED13Q9UHV7 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MED13Q9UHV7 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
MED13Q9UHV7 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MED13Q9UHV7 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MED13Q9UHV7 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.2 ms